گزارش گونه های نوکاردیای جدا سازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن 16S rRNA، اصفهان، ایران

جنس نوکاردیا جزو اکتینومیست های هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتری های ساکن خاک را شامل می شوند، که در جهان پخش شده اند. در این مطالعه، با استفاده از آزمون های تشخیصی رایج، مرسوم و مولکولی گوناگون، چندین ایزوله های نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد.
در این پژوهش، برای جداسازی از خاک، روش Slip-buried و برای استخراج DNA، روش Microwave oven استفاده شد و در این روش ها، سویه استاندارد DSM 43757 Nocardia asteroides استفاده شد. در ادامه، روش PCR با استفاده از پرایمرهای عمومی انجام شد.
با تحلیل اطلاعات فنوتیپی و مولکولی، به ویژه تعیین توالی ژن 16S rRNA، ژن های نوکاردیای های جداسازی شده از خاک اصفهان، که در ادامه به آن ها اشاره شده است، درپایگاه داده NCBI باAccession number مربوط به هر ژن ثبت شدند. نوکاردیاهای ثبت شده در NCBI: Nocardia cyriacigeorgica KC577151، Nocardia asteroides KC577152، Nocardia cummidelens KC577153، Nocardia asteroides KC577155، Nocardia asteroides KC577155، Nocardia coubleae KC577156 ..
در این پژوهش 6 گونه نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد، که برخی از این گونه های جداسازی شده از خاک ایران، اصفهان، در زمان جداسازی و تشخیص،گونه های جدیدی بودند. برای تشخیص بیشترگونه های مختلف نوکاردیا می توان در مطالعات بعدی از تکثیر و تعیین توالی ژن های دیگر این باکتری از جمله ITS،hsp65 secA، rpoB و sod بهره گرفت.