تجزیه و تحلیل پروتئوم عصاره پروتئینی باکتری Xanthomonas citri subsp. citri با خاصیت محرکی بر روی گیاه آرابیدوپسیس

در حال حاضر تحقیقات وسیعی در موسسات تحقیقاتی مختلفی در دنیا در حال انجام است که هدف آنها یافتن الیسیتورهایی جدید از میکروارگانیسم ها و گیرنده های آنها از گیاهان مختلف می باشد تا بعد از شناخت کامل این الیسیتورها و گیرنده های مربوطه آنها امکان استفاده از آنها جهت ایجاد گیاهان ترنسژنیک مقاوم علیه بیمارگرهای گیاهی مورد ارزیابی قرار گیرد. با توجه به اینکه عصاره پروتئینی باکتری (XCC) X. citri subsp. citri دارای خاصیت الیسیتوری قوی بر روی گیاه آرابیدوپسیس است، در این بررسی عصاره پروتئینی این باکتری تهیه، خالص سازی و نهایتا نمونه خالص شده که در آزمون سنجش اتیلن آرابیدوپسیس خالصیت الیسیتوری داشت، با استفاده از تکنیک طیف سنجی جرمی مورد آنالیز قرار گرفت. حدود 60 پروتئین مختلف در نمونه مورد بررسی شناسایی شد که از بین موارد شناسایی شده تنها سه مورد از نظر جرم مولکولی و نقطه ایزوالکتریک مشابه الیسیتور مشاهده شده در عصاره باکتری XCC بودند. این پروتئین ها عبارتند از cspA (پروتئین شوک سرمایی A)، cspA (پروتئین تنظیم گر ذخیره کربن) و یک پروتئین ناشناخته محافظت شده که از خانواده پروتئینی DUF1456 می باشد. با بررسی هایی که در ابزارهای SOSUI وPSORTB صورت گرفت مشخص شد که این پروتئین قابل حل در آب بوده و هیچگونه توالی مرتبط با غشاء های باکتری را ندارد و بنابراین به احتمال زیاد جزء پروتئین های سیتوپلاسمی محسوب می شود.