شناسایی و تعیین توالی ژن مربوط به آنتی پورتر هیدروژن/ سدیم از غشای پلاسمایی گیاه Kochia scoparia

یکی از راهکارهای گیاهان برای کاهش مقدار سدیم سیتوزولی، دفع سدیم به خارج سلول است. این دفع خارج سلولی، مانع از اثرهای سمی سدیم در فرآیندهای سلولی سیتوزول می شود. ناقل های سدیم/هیدروژن غشای پلاسمایی (SOS1) یکی از بهترین پروتئین های درگیر در این فرآیند هستند. در این پژوهش از گیاه دولپه و شورزی Kochia scoparia به عنوان منبع برای جداسازی ژن استفاده شد. بر همین اساس با استفاده از آغازگرهای طراحی شده در مناطق حفاظت شده در گیاهان دیگر، طول تقریبی 3600 نوکلئوتیدی و به تبعیت از آن توالی 1200 اسید آمینه ای از توالی کد کننده این ژن شناسایی و تعیین توالی شد. میزان شباهت این توالی در سطح نوکلئوتیدی با حداکثر 84 درصد همولوژی و در سطح اسید آمینه ای 92 درصد با استفاده از بررسی BLAST تایید شد. تجزیه و تحلیل های بعدی برای تعیین خصوصیات پروتئینی و ارتباط آن با پروتئین های دیگر با استفاده از مطالعات بیوانفورماتیک انجام شد و نتایج نشان داد که منطقه حاوی مارپیچ های آلفای آبگریز به عنوان قطعه گذرنده از غشای پلاسمایی است و در مقابل آن دنباله با تعداد کمتر مارپیچ های آلفای و خاصیت آبدوستی به عنوان قطعه داخل سلولی پروتئین می باشد. این نتایج نقش دفع سدیم توسط ناقل های غشای پلاسمایی را برای وجود واکنش مقاومت به شوری در گیاه کوشیا تایید نمود.