طراحی قطعات وارونه ژنتیکی موثر با ارزیابی کامل جهش های ناحیه بذری siRNAs در اپی توپ های امگاگلیادین

مکانیسم RNAi نقش مهمی در خاموشی بیان ژن های هدف توسط siRNA به عهده دارد. در تحقیق حاضر، خصوصیات in silico 30 ژن در امگا-2 گلیادین و ارزیابی جهش های قطعات 266 نوکلئوتیدی و 326 نوکلئوتیدی قبل و بعد از کلونینگ و توالی یابی برای اتصال در وکتور بیانی بررسی شدند. در این روش، پرایمرهای مخصوص برای توالی های 30 ژن با ناحیه جداکننده 75 و 178 نوکلئوتید (برای ژن تکراری وارونه) طراحی گشتند. فراوانی محل siRNA و جهش های نوکلئوتیدی A/U بهG/C با استفاده از آنالیز های in silico برای mRNA هدف شناسایی شدند. نتایج نشان دادند که توالی تکراری وارونه شامل ناحیه جداکننده 178 نوکلئوتیدی محتوی یک ژن هدف موثر بدون زوج های ناجور از A/U به G/C می باشد. در تحقیق حاضر، برای ساخت RNAi، به جای توالی اینترون، ناحیه جداکننده با قطعات طولانی طراحی گشت. همچنین، پرداختن به مشاهده بیشتر نوکلئوتیدهای ناجور در siRNA و همچنین طول ناحیه جدا کننده قبل و بعد از کلونینیگ موجب کاهش در زمان حذف اینترون گرید. نتایج حاکی از آن است که حذف اپی توپ های آنافیلاکسی وابسته به فعالیت های بدنی و بیماری سلیاک می تواند بعد از مقایسه با یک روش کاربردی مناسب و با اتصال به یک وکتور باکتریایی ایجاد گردد.