شناسایی و تجزیه وتحلیل miRNA ها و ایزومیرهای جدید و ژن های هدف آن ها در گاوهای شیری مبتلا به ورم پستان

ورم پستان یکی از بیماری های عفونی غدد پستان است که هزینه های زیادی را به صنعت گاو شیری تحمیل می کند. مکانیسم تنظیمی این بیماری پیچیده بوده و تحت کنترل ژن های تنظیمی مختلفی قرار دارد. در مطالعه حاضر به منظور درک بهتر عناصر تنظیمی درگیر در بیماری ورم پستان، نمونه های شیر گاوهای سالم و آلوده در طی سری زمانی صفر، 12، 36،24 و 48 ساعت پس از آلودگی جمع آوری گردید. داده های miRNA-seq از نمونه های شیر بدست آمد و با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی پیشرفته، miRNA های جدید، ژن های هدف آن ها، عملکرد احتمالی آن ها، ایزومیرها و همچنین miRNA* های جدید شناسایی شد. نتایج منجر به شناسایی نود و دو miRNA جدید شد که تعداد بیست و شش miRNA دارای ژن همولوگ و شصت و شش miRNA فاقد ژن همولوگ در دیگر گونه ها بود. بررسی گروه-های کارکردی ژن های هدف، موید نقش miRNAهای جدید در بسیاری از مکانیسم های مقابله با التهاب و آلودگی از جمله، پاسخ به تحریکات داخلی و خارجی، مرگ سلولی و تولید ایمنوگلوبین است. همچنین علاوه بر این، صد و سی و پنجmiRNA* جدید نیز شناسایی شد. در مطالعه حاضر 493 ایزومیر جدید شناسایی شد که در گونه هایی نظیر انسان و موش دارای عملکردهای مرتبط با ایمنی می باشند. بر اساس نتایج حاصل از این مطالعه ژن های هدف miRNAهای جدید در مسیرهای مرتبط با بیماری ورم پستان از جمله ایمنی، مرگ سلولی و التهاب نقش دارند و این مطلب می تواند موید نقش احتمالی و تنظیمی miRNA های جدید شناسایی شده در بروز ورم پستان باشد.