غربالگری بیوانفورماتیکی مهارکننده (های) پروتئاز NS3/4A ویروس هپاتیت سی از دو گیاه دارویی Cornus officinalis و Syzygium aromaticum

عفونت ناشی از ویروس هپاتیت سی یکی از معضلات مهم پیش روی سلامت عمومی ویکی از عوامل اصلی مرگ و میر در جهان است. بنابراین اخیرا پژوهش های زیادی با هدف معرفی ترکیبات جدید و موثر ضد هپاتیت سی بویژه ترکیبات گیاهی انجام شده است. هدف از پژوهش حاضر غربالگری بیوانفورماتیکی مهارکننده (های) پروتئاز ویروس هپاتیت سی از دو گیاه دارویی Cornus officinalis و Syzygium aromaticum می باشد.
ابتدا ساختار سه بعدی پروتئاز ویروس هپاتیت سی و ترکیبات غالب گیاهان مذکور به ترتیب از پایگاه داده های پروتئین وPubchem دریافت شد. سپس خصوصیات فیزیکوشیمیایی ترکیبات گیاهی و پتانسیل سمیت سلولی و جهش زایی آن ها با استفاده از نرم افزارهایSwiss ADME و Toxtree پیش بینی شد. در نهایت ترکیبات گیاهی و پروتئاز هپاتیت سی در بررسی داکینگ مولکولی با استفاده از نرم افزار iGemdock 2.1 مورد مطالعه قرار گرفتند.
نتایج نشان داد که ترکیبات مورد بررسی فاقد پتانسیل جهش زایی و سمیت سلولی هستند. نتایج بدست آمده حاکی از برهمکنش های قوی و مناسب ترکیبات مورد مطالعه با آنزیم NS3/4A خصوصا در ناحیه ی مسئول فعالیت پروتئازی است. افزون بر این مشخص شد که 1،2،6-Trigalloylglucose،Hyperoside، Isoquercitrin، Rhamnetin، Ursolic acid و Methyl salicylate برهمکنش های قوی تری را با اسیدآمینه های کلیدی جایگاه فعال آنزیم ایجاد می کنند.
بر اساس نتایج حاصل شده می توان نتیجه گرفت که ترکیبات گیاهی مورد بررسی می توانند به عنوان نامزد های مناسبی جهت بررسی های برون و درون تنی به منظور دستیابی به ترکیبات ضد هپاتیت سی مورد ارزیابی قرار گیرند.