بررسی بیوانفورماتیکی تاثیر فاکتور نورون زایی مشتق شده از مغز بر میزان بیان ژن در رده سلولی SH-SY5Y

با توجه به اهمیت بررسی و شناسایی مسیرهای حفاظتی BDNF، تحقیق اخیر با استفاده از پایگاه های داده بیوانفورماتیکی با هدف آنالیز میزان بیان ژن های ثبت شده در پایگاه داده NCBI به منظور شناخت ژن های بیان شده در رده سلولی SH-SY5Y در نتیجه تیمار با BDNF و استرس اکسیداتیو و شناسایی مسیر های حفاظتی BDNF انجام شد.
در مطالعه حاضر با استفاده از سرورهای بیوانفورماتیکی و پایگاه داده NCBI و با جستجوی کتابخانه هایی حاوی بیش از 48000 واحد داده حاصل از تجزیه  و تحلیل نرم افزار Illumina و Bid studio با نمونه برداری دستی در مرحله نخست (بر اساس P -value) و در مرحله دوم بر اساس میزان ارتباط با سازگاری نورون توسط نرم افزار SPSS  نسخه ؟ میزان همبستگی پیرسون و همبستگی اسپیرمن و رابطه خطی با سنجش میزان برازش یا رگرسیون اندازه گیری و آنالیزها انجام شد.
همبستگی پیرسون بین داده های CTR و CMP مثبت و رابطه خطی بین آن ها با اندازه گیری رگرسیون مثبت تایید گردید. بر اساس نتایج به دست آمده، درصد پروتئین های سازگار کننده نورون از داده های CTR نسبت به داده های CMP بیشتر بود. بیشترین پروتئین های حفاظت نورون مربوط به حفظ شکل سلول و اسکلت سلولی و مرتبط با بقای نورون بودند.
در نتیجه تماس نورون ها با BDNF، برخی از ژن ها به صورت اختصاصی بیان شدند؛ بنابراین این عامل می تواند سبب افزایش طول عمر و سازگاری بیشتر نورون ها باشد.