همسانه سازی، تنوع ژنتیکی ژن رمزکننده پروتئین پوششی و تعیین زیرگروه های نژادی جدایه های ویروس موزائیک خیار در مزارع طالبی شهرستان ورامین

منطقه ی ورامین واقع در جنوب تهران یکی از مراکز مهم تولید خربزه و طالبی است. اخیرا تغییر در جمعیت ویروس های کدوئیان گزارش شده است. از این رو، به منظور بررسی تنوع ژنتیکی ویروس موزائیک خیار و بررسی تغییر احتمالی جمعیت این ویروس در مزارع طالبی مناطق ورامین، پیشوا و پاکدشت، 132 نمونه ی برگی طی سالهای 1393 و 1394 با علایم مشکوک به آلودگی ویروسی شامل موزاییک، پیسک و بدشکلی برگ و نیز کوتولگی گیاه جمع آوری شد. آلودگی 59 نمونه از کل نمونه ها (69/44 درصد) به CMV توسط آزمون الایزا تعیین شد که نشان دهنده میزان آلودگی بالای گیاهان طالبی نمونه برداری شده از مزارع مورد مطالعه است. از نمونه های الایزا مثبت، آر آن ای کل استخراج و ژن پروتئین پوششی به همراه بخشی هایی از اطراف آن طی RT-PCR تکثیر شد. برای تعیین زیرگروه های جدایه های جمع آوری شده، محصولات RT-PCR با استفاده از آنزیم MspI (HpaII) برش داده شدند که در اثر آن قطعاتی به اندازه های 335 و 537 جفت باز تولید شدند. بر این اساس جدایه های جمع آوری شده در این مطالعه در گروه I قرار گرفتند. ژن CP در چهار جدایه که بر اساس فاصله مکانی انتخاب شده بودند به حامل pTG19-T متصل و در میزبانEscherichia coli همسانه سازی شد. نتایج تعیین توالی، وجود جایگاه برشی آنزیم MspI را در موقعیت یاد شده تایید کرد. چهار جدایه ی تعیین توالی شده در این پژوهش، 99-100 درصد در سطح اسید های نوکلئیک و همچنین 100 درصد در سطح آمینواسیدی با یکدیگر تشابه داشتند. میزان تشابه این جدایه ها با جدایه های از قبل گزارش شده از ایران به ترتیب 93-100 و 98-100 درصد در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی دیده شد. نتایج فیلوژنی در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی نیز نتایج RT-PCR-RFLP را تایید نمود و مشخص شد که جدایه های CMV در مزارع طالبی ورامین متعلق به زیرگروه AI و جدایه هایی با شدت بیماری زایی شدید هستند.