بررسی انتقال افقی ژن های مربوط به پروتئین های تیپ III سیستم ترشحی T3SS در چندین گونه باکتری سودوموناس با استفاده از نرم افزار SeqWord

همه باکتری ها دارای سیستم ترشحی برای انتقال ماکرومولکول های خود به بیرون هستند. در حال حاضر هفت سیستم ترشحی شناسایی گردیده است. بررسی انتقال افقی این ژن ها و بررسی و ردیابی آنها ، میتواند نقس بسیار مهمی در فهم ما در مورد نقش وکاربرد این ژن ها در باکتری و موجوات دیگر مانند میزبان آنها را دارا باشد. در این تحقیق با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی مانند SeqWord_Viewer در پایگاهای اطلاعاتی مانندMobil Genetic Elements (MGEs) , ACLAME, PAthogenicity Islands DataBase (PAIDB) به بررسی ژن های تیپ III (T3SS) در بعضی ازگونه ای باکتری Pseudomonas پرداخته شده است. نتایج نشان داد انتقال افقی در بین ژنهای تیپ سه بین 30 تا 100 درصد می باشد. همچنین باکتری گونه P. fluorescens با 15 ژن انتقال یافته بیشترین گونه را دارا می باشد. بررسی های بیوانفورماتیکی نشان داد که گونه P. fluorescens F113 با 11 ژن بیشترین قابلیت انتقال ژن های تیپ 3 سیستم ترشحی را دارا می باشد. همچنین نتایج نشان می دهد که انتقال افقی در بین ژن های تیپ سه در بعضی از گونه ها همچونP. fluorescens Pf-5، P. syringae pv. Glycinea، P. syringae pv.aptata ، P. syringae pv.Japonica ، P. syringae pv. Pisi و P. aeruginosa UCBPP-PA14 انتقال 100 درصدی در تیپ سه سیستم ترشحی مشاهده گردید. می توان از بررسی ها استنتاج کرد که باکتری هایی که احتمال بالایی در بیماریزایی دارند بیشترین انتقال افقی را دارا می باشند. که نشان دهنده انتقال سیستماتیک انتقال بیماری در بین میزبان و عامل بیماریزایی در طی تکامل می باشد.