بررسی تنوع ژنتیکی لاین های نوترکیب برنج (Oryza sativa L.) با استفاده از پزایمر میکروساتلایت

ارزیابی تنوع ژنتیکی عاملی مهم در حفاظت و شناسایی ژرم پلاسم است. در برنامه های اصلاحی، اطلاعات تنوع ژنتیکی مربوط به مناطق خاص ژنوم برنج برای کاربرد انتخاب به کمک نشانگر (MAS) و نقشه یابی ژن، بسیار مفید است. 152 لاین برای برنامه های اصلاحی، با استفاده از روش میکروساتلایت (SSR) بررسی شد. تعداد 206 آلل پلی مورفیک با میانگین 2 آلل در هر مکان SSR وجود داشت. دامنه تغییرات مقدار PIC برای مکان SSR، 0/479 تا 5/0 با میانگین 498/0 بود. بیشترین مقدار PIC برای نشانگرهای RM60، RM6832، RM3838 و RM592 و کمترین مقدار PIC به ترتیب برای نشانگرهای RM1، RM237، RM154 و RM84 بود. دامنه تغییرات تنوع ژنی Nei، 479/0 تا 0/5با میانگین 0/498 بود. با استفاده از شاخص تنوع شانون، میانگین تنوع ژنتیکی آنالیز 0/691 به دست آمد. کم ترین تنوع به ترتیب صعودی برای RM1، RM237، RM246، RM154 و RM279 بود و 27 نشانگر SSR بیشترین مقدار تنوع را داشتند(0/693). تجزیه کلاستر به روش UPGMA براساس ضریب شباهت Jaccard همه لاین ها را در سه دسته گروه بندی کرد. تجزیه ارتباط با استفاده از روش الگوی خطی عمومی (GLM) نشان داد که 62 نشانگر SSR ارتباط معنی داری با 10 صفت مورفولوژیک منتخب، داشتند. 28 نشانگر با بیش از یک صفت ارتباط داشتند که پس از آزمایش های تکمیلی می توان در برنامه های اصلاح برنج به عنوان نشانگرهای آگهی بخش و سودمند معرفی شوند. نتایج نشان دهنده توانایی نشانگرهای SSR برای شناسایی لاین های برنج در سطح DNA است. اطلاعات کسب شده به انتخاب لاین ها برای کمک به برنامه های کارآمد اصلاح برنج در ایران کمک خواهد کرد.