شناسایی مکان های ژنی مرتبط با مقاومت گیاهچه ای به بیماری لکه قهوه ای معمولی جو با استفاده از روش تجزیه ارتباطی

بیماری لکه قهوه ای معمولی با عامل قارچی Cochliobolus sativus یکی از بیماری های مهم برگی جو است. به منظور شناسایی مکان های ژنی مرتبط با مقاومت گیاهچه ای به این بیماری در یک جمعیت جو بهاره دو ردیفه اروپایی شامل  142 رقم تجاری، از داده های ژنوتیپی 407 نشانگر AFLP و SSR و داده های فنوتیپی حاصل از واکنش این ارقام نسبت به چهار جدایه عامل بیماری لکه قهوه ای معمولی جو (جدایه های Csh-1 و Csh-16 از جو و Cst-42 و Cst-151 از گندم) استفاده شد. این جدایه ها از استان های مازندران، گلستان و خراسان رضوی جمع آوری شدند. نتایج نشان داد که بیش تر ارقام مورد مطالعه در مرحله گیاهچه ای نسبت به جدایه های Csh-16 و Cst-42 مقاوم بودند، اما بیش ترین تعداد واکنش حساسیت نسبت به جدایه های Csh-1 و Cst-151 مشاهده شد. بررسی ساختار جمعیت، لاین های مورد مطالعه را به دو زیرجمعیت احتمالی (K=2) تقسیم کرد. تجزیه ارتباطی با استفاده از مدل خطی عمومی (GLM) به ترتیب شش و دوازده مکان ژنی و با استفاده از مدل خطی مخلوط (MLM) به ترتیب سه و چهار مکان ژنی مرتبط با مقاومت به جدایه های حاصل از برگ جو و گندم در سطح احتمال یک درصد (P≤0.01) شناسایی شد. این مکان های ژنی روی کروموزوم های 2H، 3H، 5H، 6H و 7H نقشه یابی شدند. تمامی مکان های ژنی شناسایی شده اختصاصی هر جدایه بودند و فقط نشانگر Bmag0225-161 با مقاومت به دو جدایه Cst-151 و Csh-1 مرتبط بود. نشانگرهای شناسایی شده پس از تایید و اعتبارسنجی می توانند در برنامه های به نژادی برای تولید ارقام مقاوم به بیماری مورد استفاده قرار گیرند.