مطالعه چند شکلی در ژن ATP1A1 و ارتباط آن با صفت نرخ باروری درگاوهای هلشتاین و سرابی

هدف از این تحقیق، مطالعه چند شکلی در ژن ATP1A1 و ارتباط آن با صفت نرخ باروری در گاوهای هلشتاین و سرابی بود. به این منظور از 124 راس گاو شیرده شامل 72 راس هلشتاین و 52 راس گاو سرابی خون گیری انجام شد. استخراج DNA با استفاده از روش بهینه یافته نمکی انجام پذیرفت. کمیت و کیفیت DNA های استخراجی با استفاده از الکتروفورز و اسپکتروفتومتری صورت پذیرفت. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر قطعه 330 جفت بازی از ناحیه مذبور انجام گرفت و برای شناسایی چندشکلی در ناحیه مذکور از روش تفاوت فرم فضایی رشته های منفرد (SSCP) استفاده شد. در نهایت جهت شناسایی چندشکلی تک نوکلیوتیدی (SNP) از هر الگوی باندی متفاوت چند نمونه جهت توالی یابی ارسال شد. نتایج حاصل از توالی یابی و هم ردیف سازی با توالی ثبت شده در NCBI نشان داد که در این ناحیه دو SNP وجود دارد که یکی از این جهش ها در ناحیه اینترون و دیگری در ناحیه اگزون اتفاق افتاده است و جهش اتفاق افتاده در ناحیه اگزون تغییری در اسید آمینه و پروتئین حاصل از این ژن ایجاد نمی کند. برای بررسی ارتباط بین این جایگاه ها با صفت نرخ باروری الگوهای باندی (هاپلوتایپ) در مدل قرار گرفت که نشان داد بین هاپلوتایپ های مشاهده شده و صفت نرخ باروری ارتباط معنی داری وجود ندارد.