بررسی ساختار ژنتیکی و تجزیه فیلوژنتیکی گوزن قرمز ایران بر اساس ناحیه D-Loop میتوکندری

آنالیز ژنتیکی جمعیت های وحشی برای حفظ تنوع زیستی و افزایش دانش در مورد بقای این گونه ها و یافتن عوامل تهدید کننده و یا کمک کننده در حفظ این جمعیت مهم و ضروری می باشد.

لذا مطالعه حاضر برای شناسایی توده ژنتیکی موجود، بررسی چگونگی روابط، شکل گیری و تنوع ژنتیکی مارال های ایرانی با بهره گیری از اطلاعات توالی ناحیه D-Loop از ژنوم میتوکندریایی انجام شد.

جهت انجام پژوهش حاضر نمونه های خون، مو یا بافت 78 راس مارال اخذ و DNA آنها استخراج گردید. ناحیه D-Loop از ژنوم میتوکندریایی با استفاده آغازگرهای اختصاصی با روش PCR تکثیر شده و تمامی محصولات PCR توالی یابی گردید. سپس توالی های مورد نظر با استفاده از نرم افزارهای BioEdit جهت بررسی تنوع نوکلیوتیدی هم تراز شد، با استفاده از نرم افزار Mega ، درخت فیلوژنتیکی رسم گردید. توالی های مارال با استفاده از نرم افزار DnaSPآنالیزشد.

نتایج حاصل منجر به شناسایی جهش هایی گردید که به ایجاد 5 هاپلوتیپ برای ناحیه D-Loop منتهی شد و تنوع هاپلوتیپی، تنوع نوکلیوتیدی و متوسط تفاوت نوکلیوتیدی برای ناحیه D-Loop به ترتیب  218/0 ، 0007/0 و 491/0 به دست آمد. شاخص های تنوع ژنتیکی نشان داد که شش جمعیت مورد بررسی مارال احتمالا تجربه باتل نک را پشت سر گذاشته است.

در پرتو نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل جمعیت ها از این هاپلوتیپ ها ، می توان نتیجه گیری کرد که نوسانات اخیر در اندازه جمعیت و وقفه در جریان ژن به دلیل انتقال گوزن های قرمز یک جمعیت به سایر زیستگاه ها در گذشته باشد.