مقایسه توالی پیشبر ژن های کنترل گل دهی، FT1 و سه نسخه از ژن VIN3 در ژنوتیپ های چغندرقند حساس و مقاوم به بولتینگ

کشت پاییزه چغندر‏قند به‏ عنوان کشت مناسب در کشاورزی پایدار به‏ شمار می‏ رود. ساقه ‏روی چغندرقند در سال اول کشت (بولتینگ) پدیده نامطلوبی است که موجب کاهش عملکرد چغندرقند می‏ شود و مهم‏ترین عامل محدود‏کننده در کشت پاییزه است. شناسایی و مقایسه توالی ژن ‏های گلدهی در ژنوتیپ‏ های مختلف می‏ تواند به درک کنترل مولکولی بولتینگ کمک کند. در پژوهش‏ های پیشین، مشخص شده است که میزان بیان ژن‏ های FT1 و VIN3 در چغندرقند با صفت مقاومت به بولتینگ در ارتباط است. در این تحقیق، توالی پیشبر ژن FT1 و توالی پیشبر سه نسخه از ژن VIN3 مربوط به گیاه چغندرقند، در سه ژنوتیپ مقاوم به بولتینگ و سه ژنوتیپ حساس به بولتینگ مورد مقایسه قرار گرفت. طراحی آغازگر‏های مربوط به هر ژن با استفاده از توالی ‏های DNA موجود در پایگاه NCBI انجام شد. از گیاهان کشت شده در گلدان، نمونه ‏های برگی تهیه و DNA آن‏ها استخراج شد و به‏ عنوان الگو در واکنش PCR مورد استفاده قرار گرفت. قطعات تکثیر شده، در حدود 1000 جفت باز برای هر پیشبر ژن، در ژنوتیپ ‏های حساس و مقاوم به بولتینگ که از نظر طول توالی پیشبر مشابه بودند، برای بررسی دقیق‏ تر توالی‏ یابی شدند. در پیشبر ژن FT1 جهشی شناسایی نشد اما، در پیشبر سه نسخه از ژن VIN3 تعداد 624 جهش از نوع جهش جایگزینی و جهش حذف و اضافه مشاهده شد. در پیشبر ژن VIN3-like1، ناحیه حذف و اضافه‏ای به طول 228 جفت باز شناسایی شد. این ناحیه عناصر پیشبر داشته و به نظر می‏رسد عملکرد کنترلی دارد. مقایسه جهش ‏های شناسایی شده بین ژنوتیپ‏ های حساس و مقاوم الگوی متمایزی برای صفت بولتینگ نشان نداد.