شناسایی ژن های میتوکندریایی تاثیر گذار بر تکامل سلول تخم تحت هورمون FSH با استفاده از داده های ریز آرایه در گاو

بلوغ تخمک شامل بلوغ هسته ای و سیتوپلاسمی است که هر دو برای لقاح و نمو رویان اهمیت دارد. برخلاف بلوغ هسته ای، بلوغ سیتوپلاسمی اووسیت را نمی توان به راحتی ارزیابی کرد. با توجه به توزیع مجدد برخی اندامک ها از جمله میتوکندری در زمان بلوغ می توان آن را به عنوان شاخص بلوغ سیتوپلاسمی در نظر گرفت. در این مطالعه به منظور بررسی اثر هورمون FSH در شرایط آزمایشگاهی بر چگونگی بیان ژن های میتوکندریایی، داده های ریزآرایه حاوی اطلاعات بیان ژن سلول های اووسیت گاو، با کد دسترسی GEO ((GSE38345 استفاده گردید. آنالیز و مقایسه بیان ژن ها در دو حالت قبل و بعد از بلوغ به ترتیب (20 و 96 ساعت بعد از تیمار) با استفاده از لینک نرم افزاری GEO2R، دو گروه ژن های افزایش و کاهش بیان یافته را تعیین نمود. برهمکنش گروه های ژنی با استفاده از پایگاه اطلاعاتی string، مجسم سازی شبکه با استفاده از نرم افزار cytoscape و هستی شناسی شبکه با استفاده از پایگاه اطلاعاتی comparative GO انجام گردید. در شبکه برهمکنش پروتیینی مربوط به ژن های افزایش بیان یافته، ژن های مهمMRPS10 ، MRPS18A، MRPL16 و MRPL17 که در فرایند های انهدام میتوکندری و ترجمه ژن های این اندامک و در شبکه ژن های کاهش بیان یافته، ژن هایMRPL22، ATP5Bو ATP5C1که با کاهش بیان خود، سعی در ایجاد تعادل در مسیر های مرتبط با انهدام میتوکندری و تولید ATP از طریق نقش در ساختار ATP سنتتاز، داشتند. در این مطالعه ژن های تنظیم کننده و همچنین مسیر های بیولوژیکی موثر به منظور درک ساز و کار اثر هورمون FSH بر روند بلوغ اووسیت از طریق اندامک میتوکندری بررسی گردیده است.