بررسی کارایی روش های مختلف استخراج آر.ان.آ در شناسایی ویروس موزاییک کدو (Squash mosaic virus)

تخریب اسید نوکلییک در طی فرآیند استخراج آن از بافت گیاهی و نیز وجود مواد بازدارنده از عمده ترین معضلات خالص سازی ژنوم ویروس های گیاهی است. به منظور ردیابی موثر ویروس موزاییک کدو از بافت خربزه از مزارع آلوده، چهار روش مختلف استخراج RNA با یکدیگر مقایسه و روش استخراج اسیدنوکلییک از این گیاه بهینه شد. کیفیت اسیدنوکلییک استخراج شده به وسیله آزمون زنجیره ای پلی مراز با نسخه برداری معکوس و به کمک دو جفت آغازگر متفاوت تعیین شد. در بین روش های استخراج تفاوت چشمگیری وجود داشت به نحوی که بعضی از روش ها قادر به ردیابی ویروس از بافت گیاهی نبودند. در بین روش های مورد مقایسه، روش استخراج dsRNA با سلولز به علت خالص سازی انحصاری اسیدنوکلییک ویروسی از بافت گیاه، بیشترین و بهترین اسیدنوکلییک را در پی داشت و ردیابی ویروس در اغلب نمونه ها را ممکن می نمود.