پیشگویی اپی توپ های پیوسته زنجیره های سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونوانفورماتیک

ایمونوگلوبولینها که نقش حیاتی در دفاع علیه میکروارگانیسم ها دارند, از زنجیره های سبک و سنگین تشکیل شده اند. زنجیره های سبک به دو ایزوتیپ کاپا و لامبدا تقسیم می شوند. تغییرات قابل توجهی در نسبت زنجیره های کاپا به  لامبدا در برخی بدخیمی های لنفوسیتهای B روی میدهد. آنتی بادیهای منوکلونال ضد زنجیره های سبک, در تشخیص و ایمونوترا‍پی ناهنجاری های پرولیفراتیو سلولهای B کاربرد دارند. هدف مطالعه حاضر تعیین اپی توپهای پیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونوانفورماتیک میباشد.

توالی اسیدهای امینه و ساختار سوم زنجیره سبک ایمونوگلوبولینIgG) G) مرجع انسان در پایگاه اطلاعاتی PDB، ساختار دوم IgG توسط نرم افزار Phyre2 و اپی توپهای پیوسته زنجیره های سبک توسط نرم افزار های Bepipred  و Ellipro تعیین شدند.

چهار اپی توپ پیوسته در دومین ثابت زنجیره سبک  ایمونوگلوبولین انسان توسط نرم افزار Bepipred شناسایی شدند . این اپی توپها درناحیه قرارگیری اسیدهای آمینه شماره 110-130, 150-,160 160-175 و180-205 واقع شده اند. شاخص ترین اپی توپ در موقعیت اسیدهای آمینه 160-175 قرار گرفته است. همچنین یک اپی توپ پیوسته در ناحیه اسیدهای آمینه 198- 203 توسط نرم افزار Ellipro شناسایی شد.

در این پژوهش تعدادی از اپی توپهای پیوسته دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین شناسایی شدند. این اپی توپها ابزارهای بسیار ارزشمندی جهت تولید آنتی بادیهای مونوکلونال شناسایی کننده اختصاصی زنجیره سبک ایمونوگلوبولین بوده و میتوانند برای تولید کیتهای تشخیصی اختصاصی زنجیره سبک، کنترل بیماریهای مونوکلونال زنجیره های سبک, درمان برخی بدخیمی های لنفوسیت B  و تعیین نقشه اپی توپهای زنجیره سبک  مفید باشند.