پیش بینی ساختار مناسب دارو با استفاده از الگوریتم تکامل تفاضلی مبتنی بر نقطه ی مخالف
نویسنده:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (دارای رتبه معتبر)
چکیده:
کشف داروهای جدید و بررسی اثرات جانبی آنها یکی از زمینههای مهم پژوهشی است که دانشمندان داروساز در آن به فعالیت مشغولند. به دلیل اثر مستقیم محصولات دارویی بر سلامت انسانها، تحقیقات داروسازی از حساسیت بالایی برخوردار بوده و رسیدن به جوابی مطلوب در این تحقیقات اغلب زمان زیادی احتیاج خواهدداشت. پیشبینی ساختار دارو به کمک نرمافزارهای شبیهسازی، راهکاری است که در سالهای اخیر مورد توجه محققین داروسازی بودهاست. در این مسئله دانشمندان به دنبال یافتن بهترین برهمکنش بین ساختار دارو و گیرنده میباشند. این مسئله در منابع علمی با نام پهلوگیریمولکولی شناخته میشود و میتوان آنرا به عنوان یک مسئله جستجو در نظر گرفت که فضای جستجو در آن حالتهای مختلف برهمکنش دارو وگیرنده میباشد. هدف نهایی از حل این مسئله انتخاب بهترین برهمکنش از میان این فضای جستجو است. در این مقاله از الگوریتم تکاملتفاضلی مبتنی بر نقطه مقابل برای یافتن بهترین حالت برهمکنش دارو و گیرنده استفاده شدهاست. برای بهبود نتایج، الگوریتم مذکور با یک روش جستجوی محلی و یک عملگر نخبهگرا تلفیق شدهاست. الگوریتم ارایهشده، مانند دیگر الگوریتمهای فرااکتشافی یک الگوریتم تکرار شونده میباشد که به کمک جمعیتی از بردارهای جواب سعی در یافتن بهترین برهمکنش دارد. همچنین تابع ارزیاب استفاده شده در این پژوهش تابع ارزیاب AutoDock میباشد. برای ارزیابی الگوریتم پیشنهادی شش ساختار متفاوت گیرنده-دارو استفاده شدهاست. نتایج حاصل از پیشبینی ساختار دارو برای هر یک از این شش گیرنده با نتایج الگوریتم ژنتیک لامارکی و الگوریتم سردسازی شبیه سازی شده و الگوریتم تکاملتفاضلی معمولی مقایسه شدهاست. بر اساس نتایج الگوریتم ارایه شده نسبت به الگوریتمهای دیگر از عملکرد بهتری برخوردار است.
کلیدواژگان:
زبان:
فارسی
صفحات:
333 تا 351
لینک کوتاه:
magiran.com/p2258748
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یکساله به مبلغ 1,390,000ريال میتوانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.
In order to view content subscription is required
Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!