توالی یابی نسل جدید و برهمکنش های ذاتی ویروس-ویروس و ویروس-گیاه

برای درک اکولوژی ویروس ها، لازم است تا اطلاعات جامع در خصوص برهمکنش های ویروس-ویروس و ویروس-میزبان در سیستم های طبیعی به دست آید. در این مطالعه، مشخص شده است که فناوری توالی یابی آر.ان.ای (RNA-Seq)، امکان این تحلیل را بدون مفروضات قبلی در خصوص آلودگی ها و علایم ویروسی یا ژن های میزبان فراهم می کند. توالی یابی نسل جدید امکان شناسایی بالقوه ی آلودگی های چندگانه را تسهیل می کند. پاسخ های ضد ویروسی میزبان به واسطه خاموشی آر.ان.ا، تحت شرایط طبیعی اتفاق می افتد. از آنجایی که تحقیقات درزمینه ویروس های گیاهی به طور عمده بر بیماری های گیاهان زراعی متمرکز بوده اند، اطلاعات کمی در خصوص این ویروس ها در محیط های طبیعی وجود دارد. توالی یابی آر.ان.ا در گیاهان مربوط به یک جمعیت طبیعی برای تعیین هم زمان حضور و عدم حضور همه ی ویروس هایی که توالی آن ها گزارش شده است، شناسایی ویروس های جدید و سنجش کمی ترانسکریپتوم میزبان مورد استفاده قرار می گیرد. با معرفی معیارهای تعداد خوانش و پوشش ژنوم، آلودگی های ناشی از ویروس آشکار شده و برهمکنش های ذاتی و پنهان گیاه-ویروس می تواند کاربردهای مهمی در کنترل این عوامل بیماری زا داشته باشد.