اولین گزارش ویروس جزیرای پیچیدگی برگ پنبه و بتاستلایت همراه آن از گیاهان ختمی، بامیه و آفتاب گردان از ایران

جنس Begomovirus بزرگترین جنس در خانواده Geminiviridae است. در این مطالعه، یک نمونه ختمی با علایم مشکوک به آلودگی بگوموویروس ها شامل کوتولگی و پیچیدگی شدید برگ از شهرستان جیرفت جمع آوری گردید و استخراج دی ان ای کل به روش CTAB، براساس دستورالعمل ارایه شده انجام شد. آلودگی این نمونه با روش توالی یابی نسل جدید مورد بررسی قرار گرفت. پس از واکاوی اطلاعات NGS، ویروس جزیرای پیچیدگی برگ پنبه (Cotton leaf curl Gezira virus, CLCuGV) و Cotton leaf curl Gezira betasatellite مرتبط با آن از نمونه ختمی بازیابی شد. سپس ژنوم کامل ویروس و بتاستلایت همراه به روش دایره غلتان و با استفاده از کیت آرسی ا تکثیر و سپس همسانه سازی و تعیین ترادف گردید. نتایج حاصل از تعیین ترادف، آلودگی گیاه ختمی به ویروس جزیرای پیچیدگی برگ پنبه و بتاستلایت مرتبط به آن را تایید کرد. بر این اساس، طول ژنوم جدایه ایرانی این ویروس و بتاستلایت همراه، به ترتیب 2761 و 1355 نوکلیوتید بدست آمد. به منظور شناسایی سایر میزبان های ویروس جزیرای پیچیدگی برگ پنبه، یک نمونه آفتاب گردان با علایم شدید چروکیدگی و فنجانی شدن برگ از مزارع دزفول استان خوزستان و پنج نمونه بامیه با علایم پیچیدگی شدید برگ از گلخانه ها و مزارع جیرفت استان کرمان جمع آوری شد. آلودگی نمونه های فوق به CLCuGV با استفاده از واکنش زنجیره ای پلی مراز و جفت آغازگرهای اختصاصی اثبات گردید و یک قطعه 730 جفت بازی تکثیر شد. وجود بتاستلایت همراه با CLCuGV در نمونه های بامیه و آفتاب گردان نیز با همسانه سازی و تعیین ترادف محصول آر سی ا اثبات گردید.