طراحی پلی توپ واکسن علیه ویبریو کلرا: رویکردی وارونه برای طراحی واکسن

طراحی واکسن درگذشته تا به امروز براساس روش های کلاسیک صورت میگیرد که زمان بر، هزینه بر و دارای ملاحظاتی هستند، اما با کشف ژنوم و تعیین توالی ژن، روش های مدرنی برای طراحی واکسن ابداع شده که از جمله آن می توان به روش طراحی واکسن به روش معکوس اشاره کرد. در این پژوهش از سرور NCBI (ORF Finder) به منظور یافتن توالی های  Coding و برای مکان یابی پروتئین از سرور PSORTb  استفاده شده و بررسی آلرژنیک بودن پروتئین از سرور  Algpred و به منظور پیش بینی اپی توپ خطی و فضایی از سرورهای  LBtope - ABCpred - IEDB CBTOPE - Disco Tope 2.0 - IEDB (Ellipro) اپی توپ نهایی انتخاب شده و سپس تجزیه و تحلیل سازه پلی توپی را توسط سرور ExPasy (ProtParam) بررسی کردیم و در نهایت با سرور JCat  توالی نوکلیوتیدی بهینه شده را بدست آوردیم. با استفاده از این روش 6074 چارچوب خوانش و همچنین 43 پروتئین سطحی و ترشحی شناسایی گردیده که در نهایت، 10 اپی توپ مناسب به عنوان کاندیدای واکسن قادر به ایجاد ایمنی در برابر طیف وسیعی از سویه ها می باشند، امید است که راه پیشرفت تولید این واکسن را بسیار آسان کنند.