بررسی تنوع فنوتیپی و ژنتیکی پاتووارهای Xanthomonas translucens، عامل بیماری باکتریایی نواری گندم و جو در بخش هایی از ایران

تعداد 12 جدایه ازمیان 67 جدایه عامل بیماری باکتریایی نواری غلات، از گندم، جو، فالاریس و چچم از مناطق مختلف استان های کرمان، کرمانشاه و فارس تهیه و خصوصیات باکتری شناسی، دامنه میزبانی، ویژگی های مولکولی و ژنتیکی آنها مورد بررسی قرار گرفت. کلیه جدایه ها گرم منفی، اکسیداز و اوره آز منفی و کاتالاز مثبت، دارای رنگ دانه زانتومونادین و قادر به تولید هیدروژن سولفوره از سیستیین و پپتون بودند. همه جدایه ها از قندهای سلوبیوز، فروکتوز، گالاکتوز، دی مانوز، آرابینوز، زایلوز، ترهالوز، آرابیتول و نمک های استات، سیترات و لاکتات استفاده نمودند، اما از سالیسین، مانیتول، ملی بیوز، رامنوز، دی تارتارات، اینولین، آدونیتول، دلسیتول، سوربیتول و مزواینوزیتول استفاده نکردند. تنها جدایه های جو قادر به استفاده از مالتوز و هیدرولیز لسیتین و نشاسته بودند. جدایه ها، ازنظر مقایسه پروتئین محلول، دارای الگوی باندی مشابه ای بودند. انگشت نگاری ژنومی جدایه ها به روش rep-PCR با استفاده از دو آغازگر ERIC و Box انجام و داده های به دست آمده با استفاده از نرم افزار NTSYSpc.2.2 و روش تجزیه خوشه‏ ای UPGMA آنالیز شدند. نتایج حاصل نشان داد همه جدایه‎ های گندم، فالاریس، چچم و یک جدایه از جو، به همراه جدایه استاندارد UPB922 در یک گروه و سه زیرگروه و بقیه جدایه های جو، که تنها روی جو بیماری زا بودند، به همراه جدایه استاندارد UPB922 با ضریب تشابه 84 درصد از گروه اول جدا و گروه دوم (با سه زیرگروه) را تشکیل دادند. براساس ویژگی های بیوشیمیایی، فیزیولوژیکی، بیماری زایی (دامنه میزبانی)، و تنوع ژنتیکی، جدایه های گروه اول به‏ عنوان پاتووار X. translucens pv. undulosa و جدایه های گروه دوم به عنوان پاتووار X. translucens pv. translucens شناسایی شدند.