تشخیص ویروس ها و ویروئیدهای گیاهی به کمک فناوری توالی یابی با توان بالا

ویروس های گیاهی باعث بسیاری از بیماری های مهم می شوند و مسیول کاهش عملکرد و کیفیت محصول در سراسر جهان هستند. شناسایی سریع و دقیق ویروس ها در یک نمونه برای سرویس های بازرسی،  قرنطینه و مدیریت بیماری مطلوب است. به تازگی، تکنیک های تعیین توالی نسل بعد (NGS) که نمایانگر یک رویکرد انعطاف پذیردر ردیابی پاتوژن گیاهی است، توسعه یافته است. از سال 2009، تکنیک های NGS در برخی نواحی ویروس شناسی گیاهی متشکل از توالی یابی ژنوم ویروس یا ویرویید، ردیابی و شناسایی، اکولوژی و اپیدمیولوژی آغاز به کار کرده است. تکنیک های NGS سریع، بسیار کارآمد و کم هزینه هستند و امکان توالی یابی چندین گیگابایت داده را در چند ساعت فراهم می سازند. در واقع، یک رویکرد عمومی برای شناسایی ویروس یا ویرویید است که نیازی به شناخت قبلی از میزبان یا ویروس ندارد. تنها با تعیین توالی کل آر.ان.ای های کوچک در یک اجرای NGS، شناسایی ویروس های دارای دی.ان.ای یا آر.ان.ای و ویروییدها امکان پذیر می شود. در این مقاله، به پیشرفت های اخیر در به کارگیری تکنیک های NGS برای تشخیص ویروس ها و ویروییدها در میزبانان آن ها پرداخته شده است.