توسعه یک واکسن چند اپیتوپی جدید علیه عفونت استرپتوکوکوس اینیایی در ماهی: یک مطالعه ایمنوانفورماتیک

استرپتوکوکوس اینیایی به عنوان یک عامل عفونی سبب ایجاد خسارات اقتصادی زیادی می شود که می تواند طیف وسیعی از گونه های ماهی را آلوده کند. محدودیت ها که در مورد واکسن های رایج و استراتژی های موجود وجود دارد منجر به شناسایی روش های جدیدی برای کنترل این بیماری می شود. در این رابطه، واکسن های مبتنی بر چند اپی توپ که بر پایه استفاده از پروتیین های مختلف ایمنوژنیک هستند می توانند امیدوار کننده باشند. مطالعه حاضر در مورد مهندسی یک واکسن چند اپی-توپی کارآمد علیه عامل استرپتوکوکوس اینیایی است. در این ارتباط، شش پروتیین ایمنوژنیک از استرپتوکوکوس اینیایی که شامل پروتیین هایFBA ، ENO، Sip11،GAPDH ، MtsB و SCPI بود برای پیش بینی اپی توپ استفاده شد. برای ساخت واکسن چند اپی توپی از بهترین اپی توپ های سلول B ، سلول T و IFNγ پروتیین های مذکور به همراه اینترلوکین-8 استفاده شد. سپس، پارامترهای مختلفی از واکسن طراحی شده از جمله ویژگی های فیزیکوشیمیایی، آنتی ژنسیتی، ساختارهای ثانویه و ساختار سوم مورد ارزیابی قرار گرفت. علاوه بر این، تعامل بین دمین اینترلوکین-8 از واکسن مهندسی شده و گیرنده آن توسط فرایند داکینگ مولکولی بررسی شد. سرانجام، توالی نوکلیوتیدی واکسن طراحی شده برای بیان در باکتری اشرشیاکلی سازگار شد. نتایج بدست امده از این پژوهش نشان داد که واکسن طراحی شده با وزن مولکولی 45 کیلو دالتون و اسکور آنتی ژنسیتی 936/0، یک واکسن پایدار است. همچنین، نتایج تجزیه و تحلیل ساختار نشان داد که واکسن طراحی شده شامل 49/23٪ مارپیچ آلفا است که 5/90٪ اسید آمینه ها در منطقه مطلوب واقع شده اند. در نهایت نیز نتایج داکینگ مولکولی نشان دادکه دمین اینترلوکین-8 از واکسن مهندسی شده می تواند با کمترین انرژی(9/1020-) به گیرنده خود متصل شود. بر اساس نتایج مستخرج از این مطالعه به نظر می رسد که واکسن طراحی شده می-تواند کاندید کارآمدی برای جلوگیری از عفونت استرپتوکوکوس اینیایی باشد