شناسایی بیوانفورماتیک دو ویروس جدید از پسته ایرانی

پسته یکی از گیاهان پر اهمیت اقتصادی بوده و به خانواده Anacardiaceae تعلق دارد. گزارش‌های مرتبط با عوامل ویروسی در این گیاه به ویرویید کوتولگی رازک، آمپلوویروس آ پسته و ویروس ب پسته محدود است. در مطالعه حاضر به منظور بررسی حضور احتمالی ویروس‌ها در پسته ایرانی به واکاوی داده‌های ترنسکریپتومیک عمومی پرداخته شد. دوازده داده با خوانش جفت شده از پایگاه داده SRA قابل دسترس در وب‌سایت NCBI اخذ گردید. آر‌ان‌ا‌های گیاهی پس از همردیف سازی داده‌ها بر روی ژنوم مرجع پسته به وسیله نرم‌افزار Hisat2، حذف گردید. توالی‌های غیر گیاهی به وسیله نرم افزارهای MEGAHIT و Trinity مونتاژ و نتیجه حاصله به منظور شناسایی توالی‌های ویروسی توسط نرم افزار BLASTx در توالی‌های مرجع ویروسی مورد جستجو قرار گرفت. دو ویروس ناشناس متعلق به خانواده Kitaviridae شناسایی و موقتا ویروس ایکس پسته (MT334618-20) و ویروس وای پسته (MT362605-06) نام گذاری گردیدند. بر اساس ساختار ژنوم، تشابه ژنتیکی و روابط فیلوژنتیک پیشنهاد می‌شود این دو ویروس ناشناخته به ترتیب به عنوان عضوی از جنس‌های Higrevirus و Cilevirus در نظر گرفته شوند. تعداد بالای توالی‌های ویروسی در نمونه‌های ریشه و برگ، احتمال آلودگی سیستمیک ویروسی ایکس پسته را مطرح می‌نماید. براساس بررسی‌های صورت گرفته، این اولین گزارش از توالی ژنومی عامل ویروسی احتمالی بر روی پسته ایرانی می‌باشد.