بررسی بیوانفورماتیکی و شناسایی نقش osa-miR164 در پاسخ به تنش غیر زیستی در برنج

MicroRNA (miRNA) گروه بزرگی از RNAهای کوچک و غیر‌‌کد‌کننده (~ 22 نوکلیوتید) هستند که در تنظیم پسا‌رونویسی بیان ژن به‌‌صورت برش mRNA هدف و یا مهار ترجمه نقش دارند. مطالعات نشان داده‌‌اند که miRNAها نقش مهمی در افزایش تحمل گیاهان به شرایط نامطلوب محیطی دارند. در این مطالعه خانواده miR164 در برنج (Oryza sativa)، مورد بررسی قرار گرفت. با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیک، توالی‌ کلیه osa-miR164 متعلق به خانواده miR164 برنج تجزیه و تحلیل شده، و پروفایل بیانی osa-miR164 تحت شرایط تنش‌های غیر‌زیستی مختلف ارزیابی شد. سپس عناصر تنظیمی سیس بر روی پیشبر‌های ژن osa-miR164 پیش‌بینی شده و به‌طور همزمان ژن‌های هدف miR164 و عملکرد آن‌ها شناسایی شد. نتایج این مطالعه نشان‌ می‌دهد نقاط حفاظتی زیادی در توالی‌های osa-miR164 بالغ وجود دارد که در توالی‌های پیش‌ساز دیده نمی‌شود. بنابراین الگوهای بیانی متفاوت اعضای خانواده ژنی osa-miR164 تحت شرایط تنش و عناصر تنظیمی متعدد سیس موجود در پیشبرهای ژن osa-miR164 ممکن است توضیحی برای الگوی بیانی متنوع osa-miR164 باشد. در این تحقیق برخی از ژن‌های هدف بالقوه osa-miR164 شناسایی و بیان آن‌ها در شرایط تنش‌های مختلف مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. در مجموع یافته‌های این پژوهش منبع با ارزشی برای شناسایی و ارزیابی بیشتر میان کنش بین ژن‌های هدف خانواده osa-miR164 در پاسخ به تنش‌های غیر زیستی فراهم می‌کند.