تنوع ژنتیکی قارچ های اندوفیت درختچه شیرخشت (‏Cotoneaster integerrimus Medik.‎‏) ارسباران‏

قارچ های اندوفیت گیاهی نقش مهمی در فعل و انفعالات فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی گیاهان در پاسخ به شرایط محیطی ایفا می کنند. در همین راستا، شناسایی قارچ های اندوفیت گونه شیرخشت در ارسباران هدف گذاری شد. نمونه های برگ و ساقه از گیاه مذکور جداسازی و پس از ضدعفونی سطحی، در محیط کشت PDA حاوی استرپتومایسین کشت شدند. پس از رشد هیف های قارچی و واکشت کردن آن ها، از محیط کشت PDB برای ادامه کار استفاده شد. برای شناسایی ایزوله های قارچی رشد کرده، استخراج DNA و واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای نواحی فاصله انداز رونویسی شونده داخلی (Internal Transcribed Spacer) انجام شد. نتایج حاصل از PCR، نشان داد که از 15 ایزوله جداسازی- شده، در 9 ایزوله قطعه ITS تکثیر شد. به طوری که 3 ایزوله در گونه Penicillium sizovae، 3 ایزوله در گونه Alternaria alternate، 2 ایزوله در جنس Penicillium و ایزوله آخر به دلیل شباهت کم توالی ITS آن با داده پایگاه، نامگذاری نشد و احتمالا گونه جدیدی باشد و نیاز به پژوهش های تکمیلی دارد. تجزیه وتحلیل فیلوژنتیک، 4 گونه مورد نظر را در 2 کلاد کاملا متمایز قرار داد، به طوری که کمترین فاصله ژنتیکی بین 2 گونه Penicillium و بیشترین فاصله نیز بین 2 ایزوله Penicillium sp و Fungal sp وجود دارد. این بررسی اولین گزارش در ارتباط با قارچ های اندوفیت شیرخشت بوده و نشان می دهد که این گونه گیاهی میزبان تعداد و طیف کمی از قارچ های اندوفیت است.