بررسی بیوانفورماتیکی تغییرات بیان رونوشت ژن های شیردان به آلودگی انگل Heamonchus contortus در گوسفندان مقاوم و حساس

هدف از این مطالعه، انجام یک بررسی سیستماتیک و متاآنالیز داده های جمع آوری شده از گوسفندان آلوده شده با Heamonchus contortus به عنوان یکی از مهمترین و بیماری زاترین انگل های دستگاه گوارش گوسفند و تجزیه و تحلیل کلی تغییر در رونوشت ژن های شیردان در پاسخ به این عفونت با استفاده از فناوری RNA-seq و ابزارهای بیوانفورماتیک بود. به منظور شناسایی ژن ها و مسیرهای مرتبط با عفونت، متاآنالیز با ترکیب مجموعه داده های مختلف عفونت Heamonchus contortus گوسفند با استفاده از بسته رنک پراد نرم افزار R انجام شد و نتایج به دست آمده برای استحصال اطلاعات بیشتر مورد تجزیه و تحلیل های پایین دستی قرار گرفتند. نتایج حاصل از متاآنالیز نشان داد که در مجموع، 1388 ژن بین نژادهای مقاوم و حساس دارای بیان افتراقی (DEGها) بودند. مطابق با نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل هستی شناسی ژن و دانشنامه کیوتوی ژن ها و ژنوم ها (KEGG)، این ژن های دارای بیان افتراقی (DEGها) در فرآیندهای زیستی متعددی مانند سوخت و ساز واحدهای یک کربنی، ترجمه، مسیر سیگنالینگ رسپتور سطح سلولی، پاسخ ایمنی، مسیرهای متابولیکی و... درگیر بودند. با استفاده از تجزیه و تحلیل برهمکنش پروتیین-پروتیین، ژن های هاب متعددی مانند آلبومین و CD4 شناسایی شدند که ممکن است نشان دهد بهبود پاسخ ایمنی ناشی از افزایش بیان ژن های مختلف در ایجاد مقاومت تاثیر می گذارد. نتایج این مطالعه، بینشی کلی از تغییرات در ترانسکریپتوم نژادهای مقاوم و حساس گوسفند و ساز و کارهای مولکولی مقاومت میزبان در نتیجه عفونت Heamonchus contortus ارایه می دهد که می تواند مبنایی برای تحقیقات بیشتر در مورد این موضوع فراهم نماید.