آنالیز پروتئین 29 کیلو دالتون (P29) پروتوسکولکس اکینوکوکوس گرانولوزوس به عنوان یک کاندید واکسن علیه کیست اکینوکوکوزیس در شرایط سیلیکو (in silico)

واکسیناسیون می تواند گامی کلیدی برای کنترل عفونت کیست هیداتید در انسان و دام در مناطق اندمیک این بیماری باشد. مطالعه حاضر با هدف تعیین برخی از خواص بیوشیمیایی پایه و به دنبال آن پیش بینی و غربال گری اپی توپ های اتصالی به سلول B و MHC پروتیین EgP29 در شرایط سیلیکو (in silico) انجام شد. برخی از خواص فیزیکی و شیمیایی پایه همراه با خصوصیات آنتی ژنی، حساسیت زایی، حلالیت، مکان های اصلاح پس از ترجمه (PTM)، مکان یابی درون سلولی، پپتید سیگنال، حوزه گذر غشایی، ساختارهای ثانویه و ثالثی و به دنبال آن محاسبه پالایش و اعتبارسنجی این پروتیین بررسی شد. همچنین، اپی توپ های سلول B با استفاده از سرورهای مختلف وب پیش بینی و غربالگری شدند، علاوه بر این اپی توپ های MHC-binding و CTL به ترتیب با استفاده از سرورهای IEDB و NetCTL نیز پیش بینی شدند. این پروتیین یک مولکول 238 اسید آمینه ای، با وزن مولکولی 27 کیلو دالتون، دارای خاصیت تحمل درجه حرارت بالا (آلیفاتیک: 71.81) و آب دوستی (GRAVY منفی) است. در توالی آن دارای چندین محل گلیکوزیلاسیون و فسفوریلاسیون و بدون دامنه گذر غشایی (transmembrane) و پپتید سیگنال است. علاوه بر این، چندین اپی توپ متصل به سلول B و MHC در پروتیین EgP29 یافت شد که می تواند برای تهیه واکسن های چند اپی توپی مورد استفاده قرار گیرد. بطورکلی، نتایج مطالعه حاضر می تواند نشانه امیدبخشی برای دستیابی به رویکردهای موثر برای تهیه واکسن چند اپی توپی علیه اکینوکوکوزیس باشد. لذا لازم است که کارآیی پروتیین و اپی توپ های آن باید in vitro و in vivo نیز مورد بررسی قرار گیرند.