شناسایی و پیش بینی عملکرد RNAهای بلند غیرکدکننده پاسخگو به تنش خشکی در عدس (.Lens culinaris L)

تنش خشکی یکی از مهم ترین عوامل محیطی است که بر رشد و بهره وری گیاهان زراعی از جمله عدس تاثیر می گذارد. در طی تکامل، تغییرات ژنتیکی حیاتی به وسیله RNAهای غیرکدکننده (ncRNAs) در پاسخ گیاهان به تنش خشکی و سایر تنش های غیرزیستی به وجود آمده است. در مطالعه حاضر، پس از شناسایی lncRNAها در پروفایل بیانی عدس، از داده های RNA-seq و واکنش Real-time PCR برای بررسی الگوی بیان برخی از lncRNAهای شناسایی شده تحت تنش خشکی استفاده شد. همچنین شبکه هم بیانی lncRNAs-DEGs با استفاده از بسته نرم افزاری psych ترسیم شد. در مجموع طی این مطالعه، 3590 توالی lncRNA در عدس شناسایی شد. تعداد زیادی از lncRNAها با ژن های مرتبط با تنظیم ریتم شبانه روزی، پاسخ به یون روی، واکنش نوری فتوسنتزی و هموستازی یونی هم بیان بودند. همچنین نتایج نشان داد که سه توالی LCUL_evgLocus_104392، LCUL_evgLocus_99066 و LCUL_evgLocus_61876 دارای بیشترین تغییر بیان در پاسخ به تنش خشکی بودند. بررسی هم بیانی این توالی ها با ژن های دارای بیان افتراقی در پاسخ به خشکی سبب شناسایی مسیرهای متابولیکی متاثر از این توالی ها گردید. این مطالعه برای اولین بار توالی های lncRNA را در عدس شناسایی نمود و گامی مفید در شناخت مکانیسم عملکرد lncRNA در چگونگی تحمل گیاهان به تنش خشکی می باشد. شبکه ها هم بیان این توالی ها و ژن های دارای بیان افتراقی می تواند سبب درک بهتر مکانیسم های پاسخ به خشکی در عدس شود.