برآورد ضریب همخونی ژنومی و اندازه موثر جمعیت در نژادهای مختلف بز

در این پژوهش، میزان همخونی ژنومی و اندازه موثر جمعیت در 879 راس بز نژادهای بیتال، تدی، پهری، نچی، بربری، دیرا دین پناه و پوس وری با استفاده از یک پنل K50 که بعد از کنترل کیفیت 36861 نشانگر  SNPو 827 راس بز بود، بررسی شد. ضریب همخونی با چهار روش ماتریس روابط خویشاوندی (FGRM)، میزان هموزیگوسیتی (FHOM)، همبستگی گامت ها (FUNI)، با نرم افزار GCTA (نسخه1/0) و قطعات هموزیگوت ژنومی (FROH) با PLINK (نسخه 1/9) محاسبه شد. اندازه موثر جمعیت (Ne) از اطلاعات عدم تعادل پیوستگی با نرم افزار SNeP (نسخه 1/1) محاسبه شد. کم ترین ضریب همخونی محاسبه شده با سه روش (FGRM، FHOM، FUNI) مربوط به نژاد بیتال و بیش ترین مربوط به نژاد بربری بود. بیش ترین میزان FROH (0/159) در نژاد بربری و کم ترین مقدار آن (0/028) در نژاد پوس وری برآورد شد. میانگین طول قطعات ROH بین 70/2 تا 391/4 مگاباز و متوسط تعداد قطعات ROH بین 8/19 تا 48/65 متغیر بود. هم چنین بیش ترین و کم ترین تعداد ROH به ترتیب روی کروموزوم های دو و 29 مشاهده شدند. اندازه Ne در نسل های حاضر (نسل پنج) نژادهای موردبررسی در دامنه 365-35 راس بود. بیش ترین Ne در نژاد بیتال (365 راس) و کم ترین در نژاد بربری (35 راس) برآورد شد. میانگین ضریب همخونی در نژادهای بیتال، تدی، پهری، نچی، بربری، دیرا دین پناه و پوس وری به ترتیب 0/035، 0/081، 0/031، 0/052، 0/15، 0/11 و 0/02 به دست آمد. هم چنین Ne اکثر جمعیت های موردمطالعه کاهش یافت. بنابراین، اقتصادی نمودن تولید و طراحی برنامه های مناسب جفت گیری برای کنترل همخونی و حفاظت از حیوانات خالص باقیمانده این نژادها ضروری  است.