شناسایی ژن های موثر در رشد و نمو ماهیچه اسکلتی در دوران آبستنی گوسفند

برنامه رشد و نمو جنینی، پاسخ ارگانیسم پستانداران در زمان رشد بحرانی است که بر روی رشد و نمو از نظر کیفی تاثیر می گذارد. مطالعه ژن ها راهی برای بهبود برنامه رشد و نمو جنینی و افزایش تولید گوشت ماهیچه اسکلتی است. در این تحقیق داده ها از پایگاه دادهGEO  با شماره دسترسیGSE23563  دانلود شدند. برای کنترل کیفیت داده های خام و آنالیز تفاوت بیان ژن ها از بسته LIMMA استفاده شد. آنالیز ژن آنتولوژی و مسیرهای زیستی با استفاده از سرور آنلاین Enrichr صورت گرفت. از نرم افزار STRING برای یافتن تعاملات بین ژن ها و از نرم افزارCytoscape  برای آنالیز بیشتر تعاملات و نمایش شبکه آن ها استفاده شد. نتایج نشان داد که در بازه زمانی 70 تا 120 روز در دوران آبستنی در مجموع 445 ژن و در بازه زمانی 120 تا 135 روز در دوران آبستنی در مجموع 84 ژن تفاوت بیان داشتند. با استفاده از نمودار مجموعه 34 ژن مشترک بین این بازه های زمانی مشخص شد. نتایج ژن آنتولوژی و مسیر نشان داد که در بازه زمانی 70 تا 120 روز تنظیم تکثیر جمعیت سلولی، رشد و نمو بافت ماهیچه ای سلولی، تمایز میوبلاست، تنظیم منفی رشد توسعه ای، تنظیم منفی فرآیند رشد و نمو، تنظیم مثبت رشد و نمو سلول، تنظیم تکثیر فیبروبلاست، مسیرهای سیگنالینگ (PI3K-Akt، HIF-1، Rap1، PPAR، MAPK) تعامل گیرنده ECM، مقاومت به انسولین و در بازه زمانی 120 تا 135 روز تنظیم تمایز سلولی، تنظیم تمایز سلول های عضلانی، تنظیم مثبت تمایز سلولی، تنظیم مثبت فرآیند رشد و نمو، تنظیم تکثیر جمعیت سلولی، تنظیم منفی رشد، تنظیم منفی تکثیر جمعیت سلولی، رشد و نمو اندام جنینی، مسیرهای سیگنالینگ (MAPK، p53) فعالیت های عملکردی و مسیر های زیستی مهم مربوط به رشد و نمو ماهیچه اسکلتی در دوران آبستنی گوسفند بودند. ژن های هاب ESR1، PTK7،  TNFSF11و CEBPB در بین ژن های مشترک بین دو بازده زمانی مشخص شدند. از این ژن ها می توان در برنامه های اصلاح نژادی برای رفع مشکلات تولد دام ها با وزن کم، کاهش تولید گوشت، بیماری های ناشی از کم وزنی دام و افزایش مرگ و میر در زمان تولد استفاده کرد.