شناسایی ژن های موثر جدید در پیشبرد مقاومت به اریترومایسین در کمپیلوباکتر ژژونی با بهره گیری از ابزار بیوانفورماتیکی

آنتی بیوتیک های ماکرولید برای درمان عفونت های ناشی از کمپیلوباکترژژونی مهم هستند. ایجاد مقاومت در برابر این دسته از آنتی بیوتیک ها در کمپیلوباکتر فرایندی پیچیده توام با تغییرات مولکولی پویا است که به خوبی تعریف نشده اند. در پژوهش حاضر برای پرکردن جای خالی موجود در ارتباط با ایجاد مقاومت آنتی بیوتیکی به درمان با اریترومایسین، پاسخ ترنسکریپتومیک کمپیلوباکترژژونی سویه ی 11168 NCTC به درمان با اریترومایسین (ERY) با روش میکرواری تعیین شد. داده های به دست آمده شناسایی، استخراج و با ابزارهای آنلاین GEO2R و نرم افزارR آنالیز شدند. ژن های با بیشترین بیان افتراقی با استفاده پارامترهای p<0.05 و |1<LogFC | شناسایی شدند. سپس، بیان ژن های مرتبط جدا و برای ژن های با افزایش بیانی، توسط پایگاه داده STRING شبکه پروتیینی در نظر گرفته شد و با نرم افزار  Cytoscape رسم شد. با شناسایی ژن های مختلف با کاهش و یا افزایش بیان معنادار، مشخص شد مجموعه ای از ژن های flaA, flaB, flgB, CmeC, sdhA, sdhB می توانند در مقاومت آنتی بیوتیکی کمپیلوباکتر ژژونی نسبت به درمان با آنتی بیوتیک اریترومایسین نقش داشته باشند. در این مطالعه با بررسی اهداف، اثرگذاری و آنالیز عملکردی این ژن ها، راهکارهای مناسبی برای مهار مقاومت ارایه گردید.