آنالیز شبکه برهمکنش پروتئین - پروتئین بر اساس ژن های تغییر بیان یافته در بافت ریه برای بیماری آنفولانزای مرغی

شیوع بیماری آنفولانزای پرندگان با مرگ و میر بالا، کاهش تولید تخم و کشتن اجباری گله های آلوده، تاثیر مخربی بر صنعت طیور دارد. براساس پروتیین مرکزی ویروس به سه زیر گروه A,B,C تقسیم می شود. ویروس آنفولانزای نوع A بسیار شایع می باشد این ویروس می تواند باعث ابتلای گونه های مختلف پستانداران و پرندگان شود و بیماری زایی بیشتری نسبت به آنفولانزای ,B,C دارد و تقریبا همه ساله باعث اپیدمی با شدت های مختلف می شود. اهداف اصلاح نژادی برای حفظ سلامت حیوانات منجر به رفاه حیوانات و جلوگیری از ضررهای اقصادی می شود. هدف از پژوهش حاضر، استفاده از روش آنالیز شبکه زیستی به منظور شناسایی نشانگرهای کلیدی جدید درگیر در بیماری آنفولانزای مرغی می باشد. در این مطالعه به منظور دستیابی سریع به مهم ترین ژن های درگیر در این بیماری داده های ریزآرایه بیان ژن مربوط به بافت ریه جوجه های آلوده به ویروس از سایت GEO با شماره دسترسی GSE53931 تهیه گردید. رسم شبکه برهمکنش پروتیین-پروتیین توسط نرم افزار Cytoscape انجام شد. آنالیز کمپلکس های پروتیینی به کمک MCODE انجام گردید. سه کمپلکس پروتیینی استخراج شد. پروتیین های seed در کمپلکس ها عبارتند از RPL10A, NOB1, MSH4 که بعنوان نشانگر کلیدی معرفی شدند، همچنین ژن های NEB، RPF1، CSRNP1، RNF146، RPL18A با کم ترین درجه بیان و ژن های SLC6A20، PLN ،SLC17A8، NOXO1، TMEM179 با بیشترین درجه بیان در مطالعه حاضر می باشند. بیشتر ژن ها در رونویسی، تکثیر، ترجمه ژن در ویروس آنفولانزا نقش دارند. آنالیزهای بر پایه شبکه می تواند به تشخیص ژن های درگیر در بیماری و ماژول عملکردی بپردازد، که این امر می تواند کمک قابل توجهی در شناسایی عوامل تنظیم کننده و فرآیندهای زیستی دخیل در پاسخ به بیماری آنفولانزای مرغی داشته باشد.