غربالگری فنوتیپی و مولکولی ژنوتیپ های مختلف برنج بر اساس نشانگرهای مرتبط با صفت عطر

کیفیت دانه یکی از اهداف بسیار مهم اصلاح برنج است. از صفات مهم در کیفیت دانه برنج، عطر آن است که حاصل بیان جهش های مغلوب ژن OsBadh2 بوده و ارزش اقتصادی برنج را تعیین می کند. در این تحقیق به غربالگری فنوتیپی و مولکولی 50 ژنوتیپ مختلف برنج بر اساس نشانگرهای مرتبط با صفت عطر پرداخته شد.

در این پژوهش 50 ژنوتیپ محلی و اصلاح شده برنج از کلکسیون موسسه تحقیقات برنج کشور تهیه شده و صفت عطر بر پایه ارزیابی بیوشیمیایی مرتبط با گزینش فنوتیپی بر اساس شدت عطر ایجاد شده در تیمار با محلول هیدروکسید پتاسیم 1/7 درصد و گزینش ژنوتیپی بر پایه الگوی باندی ایجاد شده حاصل از توالی ژنی تکثیر یافته با بکارگیری 3 جفت آغازگر اختصاصی (Badh2، Badex7-5 و Nksbad2) پیوسته با مکان های ژنی کنترل کننده صفت عطر انجام پذیرفت. برای تحلیل همبستگی میان ژن ها و فنوتیپ مشاهده شده، از مدل خطی تعمیم یافته رگرسیون لجستیک استفاده شد.

بر اساس ارزیابی فنوتیپی، 31 رقم عطری و 19 رقم غیر عطری شناخته شدند که با داده های حاصل از غربالگری ژنوتیپی مطابقت کامل داشتند، و مشخص گردید که نشانگرهای Badh2 و Nkshad2 با اطمینان و دقت بسیار بالا قادر به پیش بینی و متمایز کردن ارقام عطری و غیر عطری هستند. 

 نشانگرهای Badh2 و Nkshad2 می توانند بعنوان نشانگر کارآمد در مکان یابی ژنی جمعیت های در حال تفرق برای عطر به‎عنوان یک نشانگر همبارز به جای روش ارزیابی فنوتیپی مورد استفاده قرار گیرند.