شناسایی ژن های کلیدی و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با کم باروری در گاو (Bos Taurus): یک مطالعه بیوانفورماتیک

کم باروری یک موضوع مهم در صنعت گاوهای شیری است که می تواند اقتصاد یک مزرعه را تحت الشعاع قرار دهد. بنابراین، بررسی پدیده های بیولوژیکی که می تواند منجر به کم باروری شود، بسیار مهم است. مطالعه حاضر برای شناسایی ژن های و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با کم باروری طراحی شده است. به همین منظور، پروفایل بیان ژن آندومتر شامل 6 نمونه بارور و 5 نمونه نابارور گاو Bos Taurus از پایگاه داده GEO جمع آوری شد. ژن های با بیان افتراقی نمونه ها توسط نرم افزار آنلاین GEO2R غربالگری شدند. تجزیه و تحلیل برهمکنش پروتئین-پروتئین، تجزیه و تحلیل ماژول، تجزیه و تحلیل آنتولوژی ژن، تجزیه و تحلیل مسیرهای بیولوژیک و شناسایی ژن های کلیدی با بیان بیان افتراقی توسط نرم افزارهای با ارجاع دهی بالا انجام شد. بر اساس نتایج مقایسه نمونه های بارور و نابارور، 169 ژن به عنوان ژن های با بیان افتراقی معرفی شدند که به ترتیب حاوی 53 و 116 ژن با بیان بالا و پایین بودند. علاوه بر این، نتایج تجزیه و تحلیل ماژول وجود چهار خوشه را تایید کرد که امتیاز آنها بین 8/2 و 3 بود. نتایج تجزیه و تحلیل غنی سازی آنتولوژی ژن نشان داد که ترشح انتقال دهنده های عصبی، فضای خارج سلولی، فعالیت استروئید دهیدروژناز، چرخه وزیکول سیناپسی به ترتیب معنادارترین فرآیند بیولوژیکی، محفظه سلولی، عملکرد مولکولی و مسیر KEGG، بودند. نتایج نشان داد که 5 ژن شامل SYT1، ITGAM، HABP2، CHGA و TAT، ژن های کلیدی مرتبط با کم باروی هستند که می توانند به عنوان نشانگرهای مولکولی مناسب در برنامه های اصلاحی و مدیرت تولید مثل گاوداری ها معرفی شوند.