مقایسه ی دو روش مولکولی PCR و LAMP در تشخیص سالمونلا

روش های مختلفی جهت تشخیص سالمونلا وجود دارد. اما روش هایی که بر پایه ی ژنوم و DNA هستند، تکنیک های بهتری جهت تشخیص می باشند. PCR روشی سریع و حساس است و به علت کارایی بالا به طور گسترده ای در تشخیص سریع پاتوژن ها به کار گرفته می شود. اما دارای محدودیت هایی نیز می باشد (استفاده از دستگاه های مربوطه زمان و هزینه زیادی را می طلبد)، به همین دلیل جهت رفع این مشکلات روشی به کار گرفته شد که معایب روش های مبتنی بر PCR را به حداقل برساند.
در این بررسی از روش تکثیر هم دمای وابسته به حلقه (LAMP) استفاده شد و با PCR مورد مقایسه قرار گرفت. برای مقایسه ی PCR و LAMP از 7 سویه ی مختلف سالمونلا استفاده شد. برای انجام PCR از دستگاه ترموسایکلر استفاده شد اما در روش LAMP بدون نیاز به دستگاه گران قیمت ترموسایکلر و تنها با استفاده از یک بلوک دمایی ساده و ارزان، ساخت داخل کشور تشخیص انجام شد.
نتایج نشان داد که هر دو روش LAMP و PCR به طور اختصاصی قادر به شناسائی سالمونلا می باشند. روش LAMP بر خلاف PCR که بر روی ژل الکتروفورز الگوی تک باند ایجاد می نماید یک الگوی نردبانی ایجاد می نماید و در کنترل منفی هیچ باندی مشاهد نمی شود. همچنین روش LAMP 100 برابر حساس تر از PCR معمولی است. بر اساس نتایج این تحقیق در روش LAMP در عرض کمتر از 90 دقیقه تشخیص انجام شد ولی در PCR معمولی تشخیص بیش از 3 ساعت به طول انجامید. مزیت دیگر این روش عدم وابستگی به چرخه های دمایی و دستگاه ترموسایکلر بود.
روش LAMPدر مقایسه با PCR تقریبا 3 برابر سریع تر، 100 برابر دقیق تر، 10 برابر ارزان تر است که می تواند کاربرد گسترده ای در آزمایشگاه های تشخیص پزشکی، پزشکی قانونی، کشاورزی، تحقیقاتی و آزمایشگاه های کوچک و سیار داشته باشد و جهت مطالعات همه گیرشناسی، تشخیص و شناسایی مورد استفاده قرار گیرد.