ارزیابی رتروترنسپوزون ها به عنوان نشانگرهای ملکولی در گندم

رتروترنسپوزون ها به عنوان نشانگرهای ملکولی در گندم، فعالیت 30 خانواده مختلف رتروترنسپوزونی متعلق به گندم و گونه های به لحاظ تکاملی نزدیک به آن مانند جو، یولاف، برنج، ذرت و براکیپودیوم در گندم بررسی شد. تقریبا تمامی آغازگرهای مبتنی بر رتروترنسپوزون های جو، یولاف و براکیپودیوم و درصد بالایی از آغازگرهای مبتنی بر رتروترنسپوزون های برنج و ذرت الگوی واضح و قابل امتیازدهی را نشان دادند. رتروترنسپوزون های Bare-1/Wis2-1A (گندم)، Frodo TRIM (جو)، LTR یولاف، Sukkula (جو)، Bagy2/Wilma (گندم)، Daniela (گندم)، Fatima (گندم) و Cerebera (جو) فعال بودند. بیشتر آغازگرهایی که براساس نواحی محفوظ توالی رتروترنسپوزون ها بویژه نواحی انتهایی LTR طراحی شده بودند الگوی نواری واضحی تولید کردند. الگوی مطلوب تکثیر با تک آغازگرها و ترکیبات آغازگری خانواده های رتروترنسپوزونی مورد استفاده، نشان داد که این خانواده ها به حالت معمولی و آشیانه ای در ژنوم گندم قرار می گیرند. همچنین الگوی مطلوب تکثیر حاصل از تک آغازگرهای مبتنی بر نواحی ''5 یا ''3 LTR و ترکیب آغازگرهای مربوط به نواحی''5 و ''3 LTR های خانواده های مختلف در واکنش های IRAP (Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism)، حاکی از قرارگیری رتروترنسپوزون ها به صورت سر به سر، دم به دم و سر به دم در ژنوم گندم می باشد. با توجه به این مطالعه پیشنهاد می شود از این نشانگرها برای مطالعه ی تنوع ژنتیکی، تهیه ی نقشه های ژنتیکی و مکان یابی ژن ها و صفات در گندم و دیگر محصولات زراعی استفاده شود.