تعیین پاتوتیپ جدایه های اشریشیا کلی از گوساله و طیو ر در ایران با استفاده از روش ریزآرایه DNA
ردیابی ژن های مربوط به عوامل حدت که در یک سویه از اشریشیا کلی حضور دارند جهت تعیین پروفایل ژنوتیپی و همچنین قرارگیری سویه در پاتوتیپی خاص از اهمیت فوق العاده ای برخوردار است.
هدف از انجام این مطالعه تعیین پاتوتیپ جدایه های مختلف E. coli جدا شده از گوساله ها و طیور بومی ایران با استفاده از تکنیک ریزآرایه می باشد.
در مطالعه حاضر تعداد 67 جدایه از اشریشیا کلی پس از جداسازی، با استفاده از روش نوین ریزآرایه DNA (DNA Microarray) جهت تعیین پاتوتیپ هر جدایه مورد بررسی قرار گرفتند. در آرایه مورد استفاده پروب های ژنی مرتبط با 263 فاکتور حدت مختلف اشریشیا کلی قرار داشتند.
نتایج حاصل نشان دهنده این امر بود که از سویه های جدا شده از اسهال گوساله ها، 47 درصد به پاتوتیپEHEC، 68.15 درصد به پاتوتیپEPEC، 68.15 درصد پاتوتیپ UPEC، 96.1 درصد به پاتوتیپETEC، 96.1 درصد ترکیبی از پاتوتیپ های EPEC وUPEC بوده و 17.64 درصد سویه ها غیر قابل اختصاص به پاتوتیپی خاص بودند و در مورد سویه های جدا شده از کلی باسیلوز طیور 62.5 درصد به پاتوتیپAPEC، 25.31 درصد به پاتوتیپ ExPEC و 6.25 درصد سویه ها غیر قابل اختصاص به پاتوتیپ خاصی بودند.
نتیجه گیری نهایی: مطالعه حاضر نشان دهنده این امر می باشد که روش نوین ریزآرایهDNA در مقایسه با روش های مولکولی مرسوم قادر است تعداد بالایی از ژن های حدت را در یک زمان و در مدت زمان کوتاهی بخوبی ردیابی کرده و در تعیین پروفایل ژنتیکی و تعیین پاتوتیپ ها مورد استفاده قرار گیرد.
پاتوتیپ ، اشریشیا کلی ، عوامل حدت ، روش ریزآرایه ، DNA
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.