شهید مرتضی آقاعلیجانی در اول تیر 1346 در روستای خیارج از توابع شهرستان بویین زهرا در خانواده مذهبی و عاشق اهل بیت علیهم السلام به دنیا آمده و دوران کودکی را در روستا طی کرد.

وی که درس خود را در مقاطع ابتدایی تا پایان دوره متوسطه به خوبی و با موفقیت در شهرستان قزوین و کرج سپری کرده بود پس از اخذ مدرک دیپلم به خدمت نظام مقدس سربازی اعزام گردید.

وی که در صحنه های مختلف انقلاب و بعد از آن حضوری موثر و مستمر داشت، پس از خدمت، حدود 7 ماه در ارتش جمهوری اسلامی و حضور 4 ماهه در جبهه های نبرد، موفق به قبولی در کنکور سراسری و قبولی در دانشگاه کشاورزی زنجان شده و به ادامه تحصیل در دانشکده کشاورزی زنجان پرداخت.