با این که یکی از مهم ترین محورها و پایه های اقتصاد مقاومتی، تکیه بر اقتصاد دانش بنیان است، اما نگاهی به راه طی شده نشان می دهد این دو موضوع مهم که با هم دیده می شوند، دچار مشکلات یکسانی در اجرا هستند که باید برای رفع آن فکری کرد. در واقع باید گفت، راه حل عمده مشکلات اقتصادی ایران از اقتصاد مقاومتی مبتنی بر اقتصاد دانش بنیان می گذرد و دولت باید با تکیه بر توان مردمی در این راستا گام بردارد.

بر این اساس، مشکل اجرایی نشدن اقتصاد دانش بنیان به قبل از ابلاغ سیاست اقتصاد مقاومتی برمی گردد. اقتصاد دانش بنیان در تعریف عمومی به این معناست که فعالیت های تولیدی بر اساس دانش انجام شود و بر این اساس