همسانه سازی مولکولی، جداسازی و توصیف یک ژن پکتات لیاز از بافت حبه انگور بیدانه سفید (Vitis vinifera L. cv. Bidaneh Sefid)

یکی از فعالیت های مهم سلول های گیاهی در دوره رشد آن، فعال نمودن ژن های عامل و آنزیم های موثر در تجزیه برخی مواد ذخیره شده در مراحل اولیه تشکیل میوه است. براساس مطالعات انجام شده، آنزیم های مختلفی در تخریب دیواره سلولی و نرم شدن بافت میوه نقش دارند. از مهم ترین این آنزیم ها، آنزیم پکتات لیاز می باشد. در این مطالعه، cDNA ناقص یکی از ژن های پکتات لیاز از بافت حبه انگور بیدانه سفید (Vitis vinifera L. cv. Bidaneh Sefid) با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره ای پلی مراز نسخه برداری معکوس (Reverse Transcriptase-PCR) جداسازی و در ناقل pUC19 همسانه سازی و ساختار مولکولی، ویژگی-های بیوشیمیایی و فیلوژنتیکی آن مورد بررسی قرار گرفت. توالی نوکلئوتیدی این ژن، تحت عنوانVvPel1، به طول bp429 بوده و یک پروتئین با 143 اسیدآمینه را رمز می کند. وزن مولکولی محاسبه شده و نقطه ایزوالکتریک پیش بینی شده این پروتئین به ترتیب برابر 78/15 کیلو دالتون و 53/6 می باشد. بررسی ساختارهای دوم و سوم توالی پروتئینی VvPel1 نشان داد که این پروتئین از نظر ساختاری مشابه با توالی های پکتات لیاز گزارش شده از موجودات دیگر می باشد. توالی پروتئینی بدست آمده شباهت زیادی را با توالی های پکتات لیاز سایر گیاهان نشان داد. بررسی فیلوژنتیکی نیز مشخص کرد که این ژن به زیرگروه I پکتات لیازهای گیاهی تعلق دارد.