شناسایی مولکولی و تجزیه تحلیل تبارزایی ویروس موزاییک خیار زیرگروه IB جداشده از گیاه دارویی ختمی

ویروس موزاییک خیار Cucumber mosaic virus (CMV)، از جنس Cucumovirus و خانواده Bromoviridae می باشد. ختمی (Althaea officinalis) گیاهی یک ساله و خودرو از تیره پنیرکیان است که گل، میوه و ریشه آن مصارف دارویی دارد. در این تحقیق، پنج نمونه مشکوک به آلودگی با CMV از گیاه ختمی جمع آوری و وجود CMV با آزمون های سرولوژیکی از جمله DAS-ELISA، از نمونه ها ردیابی شد. از بین آن ها، جدایه Ta-alth انتخاب و پس از استخراج RNA کل از گیاه آلوده به آن، با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ناحیه ژن پروتئین پوششی، RT-PCR انجام و قطعه 675 جفت بازی تکثیر شد. قطعه تکثیر شده درون پلاسمید pTZ57R/T همسانه سازی و سپس تبدیل سلول های مستعد Escherichia coli سویه DH5α انجام گردید. جهت حصول اطمینان از قرارگرفتن قطعه موردنظر درون حامل، تجزیه تحلیل پلاسمید نوترکیب خالص سازی شده با استفاده از آنزیم های برشی انجام و توالی قطعه تکثیری تعیین گردید. توالی به دست آمده با استفاده از برنامه GeneDoc با توالی های متناظر سایر جدایه های CMV از ایران و نقاط دیگر دنیا (موجود در بانک ژن) مقایسه و درخت تبارزایی با استفاده از روش Neighbor-Joining(NJ) و برنامه TREECON رسم گردید. تجزیه تحلیل ترادف ژن پروتئین پوششی جدایهTa-alth نشان داد که این جدایه متعلق به زیرگروه IB ویروس موزاییک خیار می باشد. این اولین گزارش از آلودگی ختمی به CMV در ایران است.