شناسایی مولکولی اکتینومیسیت های مولد موادضد باکتریایی علیه پاتوژن های بیماری زا از خاک های استان آذربایجان شرقی

اکتینومیسیت ها باکتری هایی گرم مثبت و رشته ای هستند که بخش اعظم میکروارگانیسم های خاک را در بر می گیرند. بر اساس مطالعات انجام یافته، سه چهارم از کل آنتی بیوتیک های شناخته شده را اکتینو میسیت ها تولید می کنند. در همین راستا غربالگری برای فعالیت ضدباکتریایی ونیز شناسایی آنها از ژن 16SrDNA استفاده شد.
هدف این مطالعه شناسایی آکتینومیسیت های مناطق مختلف استان آذربایجانشرقی از جهت خواص آنتی باکتریائی و بررسی سویه های فعال با استفاده از ژن 16SrDNA می باشد.
ایزوله های اکتینومیست از نمونه خاک های جمع آوری شده استان آذربایجانشرقی جدا سازی شد، غربالگری اولیه به روش تست دولایه (Bilayer) درمحیط کشت اگار وغربالگری ثانویه با روش انتشار در اگار(Disk Diffusion Method) در مقابل میکروارگانیسم های آزمایشی: E. coli ATCC 1399، B. cereus ATCC 1431، Y. enterocolitica ATCC35669، S. aureus ATCC 29213 انجام شدند. جهت شناسایی مولکولی، ابتدا، DNA ژنومیک از تمام باکتری های منتخب استخراج شد و سپس، ژن 16SrDNA ایزوله های مذکور با تکنیک PCR تکثیروتوسط شرکت Macrogene توالی یابی شد. نتایج حاصل با استفاده از برنامه های بیوانفورماتیک آنالیز شده وایزوله های مذکور شناسایی شدند.
از 110 نمونه خاک جمع آوری شده، 310 ایزوله اکتینومیست جدا شدند،44 ایزوله درغربالگری اولیه و12 ایزوله در غربالگری ثانویه انتخاب شدند، ژن 16SrDNA، 5 ایزوله توالی یابی شدند. توالی یابی نشان داد که ایزوله C91 با 97درصد به Streptomyces sampsonii، G41 با 96 درصد به Streptomyces mediolani، F51 با82 درصد به Streptomyces lividans و E45با98 درصدبه Streptomyces albogriseolus، شباهت دارد.
نتایج این تحقیق نشان می دهد ایزوله های جدیدی در نمونه خاک های استان آذر بایجان شرقی وجود دارد که توانایی تولید مواد آنتی باکتریایی جدیدی دارند.