همسانه سازی و بررسی ژن های شبه سایکلوتاید در ذرت

سایکلوتایدها دستهای بزرگ از پپتیدهای حلقوی هستند که فعالیتهای زیستی متنوعی دارند. از جمله میتوان به فعالیت ضد میکروبی، ضد توموری، ضد ویروسی، تخریب گلبولهای قرمز، سلولکشی و حشرهکشی اشاره کرد. شبه سایکلوتاید ها در گیاهان به صورت خانواده ژنی بیان شده و دارای نواحی حفاظت شده میباشند. در این پژوهش بر اساس توالی نواحی حفاظتشده پروتئین آغازگر طراحی شد و با استفاده از تکنیک RACE-PCR ''3 ژن های کدکننده پروتئین های شبه سایکلوتاید در ذرت همسانه سازی و تعیین توالی شدند. مقایسه توالی های بدست آمده با توالی های موجود در پایگاه داده های ژنی PGIشان داد که تعداد نه ژن شبهسایکلوتاید جدید در ذرت به دست آمده است. مقایسه توالی نوکلئوتیدی و اسیدآمینهای این ژنها آنها را به دو دسته تقسیم کرد. دسته اول شباهت زیادی با سایر شبه سایکلوتاید های موجود در پایگاه داده های ژنی داشته و دارای نواحی حفاظت شده سایکلوتایدی بودند. دسته دوم دارای ساختار منظم سایکلوتایدی نبودند و تعداد نوکلئوتید های این دو دسته از 485-413 متغیر بود. این اولین گزارش در زمینه همسانهسازی ژنهای شبه سایکلوتاید در گرامینه ها بود و نشان داد که ذرت تنوع بالایی از این ژنها دارد.