بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های Ascochyta rabiei، عامل برق زدگی نخود در استان لرستان با استفاده از نشانگر SSR

بیماری برق زدگی با عامل Ascochyta rabiei یکی از مخرب ترین بیماری های نخود است. در این تحقیق، با هدف مطالعه ساختار ژنتیکی قارچ عامل بیماری، نمونه برداری به صورت تصادفی از مزارع هشت منطقه مختلف استان لرستان (ازنا، الشتر، بروجرد، پلدختر، چگنی، خرم آباد، کوهدشت و نورآباد) صورت گرفت. پس از کشت نمونه ها روی محیط کشت اختصاصی آرد نخود، دکستروز و آگار، جدایه های قارچی با روش نوک هیف خالص سازی شد و تعداد 53 جدایه خالص به دست آمد. تنوع ژنتیکی جمعیت قارچ با نشانگر توالی تکراری ساده و با استفاده از پنج جفت آغازگر اختصاصی ارزیابی شد. تعیین تشابه جدایه با استفاده از ضریب شباهت دایس و روش الگوریتم UPGMA انجام گرفت. تجزیه خوشه ایداده ها نشان داد که جدایه ها در فاصله ژنتیکی برابر با سطح تشابه 3/0 درصد در 9 گروه ژنوتیپی مشخص قرار می گیرند. آنالیز PCOA داده ها با استفاده از ماتریس تشابه جاکارد در نرم افزار NTSYS صورت گرفت و طبق نتایج، از بین 53 مولفه به دست آمده، 15 مولفه دارای مقادیر ویژه بزرگ تر از 1 بودند و 49/90 درصد تنوع موجود را توجیه کردند. آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد که بیشترین مقدار تنوع ژنتیکی (96درصد) در داخل جمعیت توزیع شده بود و تنوع ژنتیکی بین جدایه های مختلف 4 درصد تعیین گردید. نتایج این تحقیق نشان می دهد که بین جدایه های جمع آوری شده از مناطق مختلف استان تنوع ژنتیکی زیادی وجود دارد.