شناسایی و توالی یابی ژن MT-COX1 در مرغ بومی خراسان

هدف از انجام این پژوهش بررسی توالی نوکلئوتیدی ژن سیتوکروم اکسیداز 1 در ژنوم میتوکندری مرغ بومی خراسان و شناسایی جهش های احتمالی در آن بود. بدین منظور پس از نمونه گیری و استخراج DNA از خون کامل، ژن COX1 با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و در پلاسمید pTZ57R/Tدر سویه DH5α باکتری اشیریشیاکولای همسانه سازی گردید. در نهایت پلاسمید نوترکیب از یک کلونی نوترکیب استخراج و پس از خالص سازی توالی یابی شدند. نتایج هم ردیفی نوکلئوتیدی این توالی 99 درصد شباهت با توالی مشابه در ژنوم نوکلئوتیدی مرغ مرجع (با شماره دسترسی x 52392.1) را نشان داد. مقایسه ایندو توالی وجود 6 اختلاف نوکلئوتیدی را مشخص نمود. با این حال فقط سه جهش منجر به تولید اسیدهای آمینه غیرهمسان گردید. همچنین نتایج حاصل از مقایسه پروتئینی، شباهت 99% در 100% طول را با ناحیه حفاظت شده، زیرواحد 1 سیتوکروم Cاکسیداز مرغ مرجع را نشان داد. بعلاوه در این مطالعه مشخص گردید که مرغ بومی خراسان در توالی های پروتئینی ژن COX1 با سایر نژاد های طیور بیش از %96 شباهت دارد..