بررسی بیوانفورماتیکی ارتباط اندازه ی ژنوم با خصوصیات ژنتیکی و رفتاری باکتری های بیماری زا

با افزایش تعداد باکتری هایی که توالی یابی می شوند، نیاز به بهره برداری از این داده ها نیز بیشتر می شود. استفاده از این اطلاعات ژنومی از طریق به کارگیری همزمان علوم بیوانفورماتیک و باکتری شناسی امکان پذیر می باشد. مطالعه ی بیوانفورماتیکی اندازه ی ژنوم باکتری های بیماری زا، تنوع قابل توجهی را نشان می دهد. فرضیات زیادی در مورد علت این تنوع و همچنین ارتباط اندازه ی ژنوم و فرایندهای اساسی باکتری مطرح است. هدف از انجام این مطالعه بررسی ارتباط اندازه ی ژنوم با تعدادی از خصوصیات ژنتیکی و رفتاری باکتری های بیماری زا بود.
اطلاعات توالی ژنوم 100 گونه باکتری بیماری زا از منابع گوناگون جمع آوری شد. ارتباط اندازه ی ژنوم با چند خصوصیت باکتری های بیماری زا مورد ارزیابی قرار گرفت. برای آنالیز داده ها، از نرم افزاری SPSS نسخه ی 19 استفاده شد.
اندازه ی ژنوم در باکتری های بیماری زا، ارتباط معنی داری با تعدادی از خصوصیات ژنومی مانند درصد C + G، تعداد کلی ژن ها، پروتئین ها، سودوژن ها (Pseudogenes)، ژن های کسب شده و برخی از خصوصیات رفتاری و اکولوژیکی باکتری مانند تحرک، محدوده ی میزبان و تنفس نشان می دهد. هیچ گونه ارتباط معنی داری بین اندازه ی ژنوم، تراکم ژن در طول ژنوم و همچنین درصد DNA غیر کد کننده وجود ندارد.
در باکتری های بیماری زا، DNA انعطاف پذیری بالایی دارد و در طی تکامل، دچار کاهش اندازه می شود. در طی این روند، باکتری ها تعدادی از ژن های خود را از دست می دهند و تعداد کمتری نیز ژن کسب می کنند. این عوامل با کاهش تعداد پروتئین ها، کاهش درصد C + G و محدود ماندن زیستگاه باکتری همراه است.