بررسی ایمونوانفورماتیکی پروتئین تروپومیوزین کنه بوافیلوس

کنه بوافیلوس سبب انتقال برخی از اجرام پاتوژن و کاهش تولید در گاو می شود. پروتئین تروپومیوزین، تنظیم گر فعالیت اکتین بوده و نقش مهمی در واکنش های ایمنی، آلرژی و تهیه واکسن دارد.
روش های مرسوم شناسایی دقیق شاخص های آنتی ژنتیک (اپی توپ ها)، طاقت فرسا، زمان بر و پرهزینه است، لذا توجه ما در این مطالعه به سمت توسعه روش های سریع تر نظیر پیشگویی اپی توپ های احتمالی مورد شناسایی سلول B و +4TCD، مبتنی بر توالی و ساختار پروتئین می باشد.
از گستره وسیعی از برنامه ها و ابزارهای ایمونوانفورماتیک جهت آنالیز آنتی ژنسیتی، فراوانی ساختار ثانویه پروتئین و دومن ها، فاکتورهای فیزیکوشیمیایی مرتبط با مکان اپی توپ های خطی، اپی توپ های سلول B، قطعات پپتیدی متصل شونده به آلل های MHC کلاس 2 گاو استفاده گردید.
آنالیز پروتئین با الگوریتم های مختلف و انتخاب اپی توپ های مورد توافق در بیشتر ابزارها منجر به به دست آمدن سه پپتید برگزیده با خاصیت اپی توپی برای سلول B 80-62-EQLSQANSKLEEKDKALQA-COOH) AA2(NH، 185-170-AMVEADLERAEERAETG-COOH) AA2(NH و 218-200-VGNNLKSLEVSEEKALQKEET-COOH)AA2(NH و یک پپتید برای سلول T 207-192-LEEELRVVGNNLKSL-COOH) AA2(NH گردید.
نتیجه گیری نهایی: جهت تحریک رضایت بخش سیستم ایمنی تنها قطعاتی از پروتئین (اپی توپ ها) کافی می باشد. انتخاب اپی توپ های بهینه سبب تمرکزپاسخ ایمنی و تهیه واکسن مناسب شده و از پاسخ های آلرژیک و نامطلوب می کاهد.