ارزیابی روابط فیلوژنتیکی گونه های Trichoderma به دست آمده از شالیزارهای استان مازندران بر اساس توالی های ژن tef1α

جنس Trichodermaاز مهم ترین جنس های قارچی در زمینه کنترل بیولوژیک بیماری های گیاهی، افزایش رشد و القای مقاومت در گیاهان به شمار می رود. ارتباط فیلوژنتیکی 81 جدایه متعلق به شش گونه از این جنس (شامل چند جدایه بیوکنترل امید بخش) که از مزارع برنج استان مازندران به دست آمده اند، بر اساس توالی قطعه ای از ژن αtef1بررسی شد. توالی های ژن مذکور در جدایه های مورد آزمایش به همراه توالی های به دست آمده از بانک ژن هم ردیف سازی شدند و تجزیه و تحلیل داده ها با روش های پیوست همسایه ها، پارسمونی بیشینه و تکامل کمینه انجام شد. نتایج نشان داد که جدایه های متعلق به T. harzianum (فراوان ترین گونه شالیزار در این تحقیق) 14 هاپلوتیپ مختلف را تشکیل دادند که در پنج گروه مجزا قرار گرفتند و بنابراین این گونه ی مرکب، بیشترین تنوع ژنتیکی را به نمایش گذاشت. جدایه های T. virens (دومین گونه فراوان مزارع برنج مازندران در این بررسی) فقط در دو هاپلوتیپ گروه بندی شدند. گونه های T. atroviride و T. hamatum با سه و دو جدایه به ترتیب سه و دو هاپلوتیپ را تشکیل دادند. سویه های بیوکنترل متعلق به یک گونه دارای هاپلوتیپ های متفاوتی بودند و همراه با سویه های غیر آنتاگونیست در شاخه های جداگانه ای قرار گرفتند. در نتیجه، هاپلوتیپ منحصر به فردی از αtef1 که به خاصیت آنتاگونیسم مرتبط باشد، بر اساس تجزیه و تحلیل توالی αtef1تشخیص داده نشد. ارتباطی بین هاپلوتیپ و مکان جغرافیایی وجود نداشت و از یک مزرعه، گونه ها و هاپلوتیپ های مختلف جداسازی شدند.